RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD34Q06665 692 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CDA1Q06702 301 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ENT4Q07872 247 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR030WQ07967 263 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C XYL2Q07993 356 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL073CQ08232 322 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOL131WQ08270 108 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC13Q08630 104 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MCH5Q08777 521 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR389WQ08912 624 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YIG1Q08956 461 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GRE1Q08969 168 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL278CQ08990 100 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR223WQ12015 292 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR056CQ12025 205 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PUS9Q12069 462 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG29Q12092 213 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NMD4Q12129 218 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HAL9Q12180 1030 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SIA1Q12212 622 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GLO4Q12320 285 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PST1Q12355 444 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPE4Q12455 300 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR111WQ12528 110 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YKL068W-AQ3E826 78 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RGS2Q99188 309 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEM1O94742 89 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATP2P00830 511 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HEM2P05373 342 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LEU4P06208 619 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RHO2P06781 192 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC21P06785 304 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD3P06839 778 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MST1P07236 462 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG20P08524 352 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TY2A-FP0CX61 438 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TY2A-GR2P0CX62 438 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LAT1P12695 482 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPT15P13393 240 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RSR1P13856 272 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NSP1P14907 823 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HSC82P15108 705 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C POL30P15873 258 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO16P17122 198 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SRV2P17555 526 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AAC3P18238 307 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TEC1P18412 486 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TYR1P20049 452 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C URA4P20051 364 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MSB1P21339 1137 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC62P21825 274 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PTP1P25044 335 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC10P25342 322 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRX3P25372 127 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CHA1P25379 360 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPS22P25380 463 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TY2A-CP25383 438 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MXR2P25566 168 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LDB16P25587 256 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARE1P25628 610 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CWP1P28319 239 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PMT2P31382 759 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MVD1P32377 396 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATP11P32453 318 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG1P32476 496 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GCD11P32481 527 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PET309P32522 965 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC5P32562 705 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SRB5P32585 307 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C KAP122P32767 1081 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ORC2P32833 620 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UGP1P32861 499 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SUI1P32911 108 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SFC1P33303 322 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data0.67□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C SDH3P33421 198 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SPO23P33757 523 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SEF1P34228 1148 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YKL100CP34248 587 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SQT1P35184 431 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NUP120P35729 1037 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OAR1P35731 278 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NTR2P36118 322 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RPC37P36121 282 aa0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YKR078WP36158 585 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL15P36523 253 aa0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms