RNA–Protein interactions for RNA: YOL050C

YOL050C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOL050C, Length 321 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOL050C	YOL050C	ALT2	P52892	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOL050C	YOL050C	MSS11	Q03825	758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOL050C	YOL050C	YAP7	Q08182	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOL050C	YOL050C	SFI1	Q12369	946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOL050C	YOL050C	RTN2	Q12443	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOL050C	YOL050C	TYR1	P20049	452 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	ACH1	P32316	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	PMT1	P33775	817 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	DUG2	P38149	878 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	SAM50	P53969	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	NUP53	Q03790	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	TAP42	Q04372	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	FMP42	Q04991	504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	THI20	Q08224	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	THP1	Q08231	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	BAR1	P12630	587 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	CDC23	P16522	626 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	NFU1	P32860	256 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	MIC60	P36112	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	SLG1	P54867	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	SPC19	Q03954	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	GLN3	P18494	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	MSN2	P33748	704 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	MBB1	P39534	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YTA12	P40341	825 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	AZF1	P41696	914 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	HXT14	P42833	540 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	COR1	P07256	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	ECM15	P35195	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	BNA4	P38169	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	CSM2	P40465	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	GLO2	Q05584	274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	FMP45	Q07651	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YEH2	Q07950	538 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	BUD14	P27637	709 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	VPS17	P32913	551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	VTC2	P43585	828 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	CUL3	P53202	744 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	BNA5	Q05979	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	APE1	P14904	514 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YCR007C	P25354	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	UTR4	P32626	227 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	BZZ1	P38822	633 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	SLD5	Q03406	294 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	RBA50	Q04418	439 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YOL050C	YOL050C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	YGL082W	P53155	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	SEC62	P21825	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	TRS65	P32893	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	RIM2	P38127	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
YOL050C	YOL050C	YGL108C	P53139	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	VTA1	Q06263	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	SYO1	Q07395	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	RAV1	P47104	1357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	CLB3	P24870	427 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	SAS3	P34218	831 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	BYE1	P36106	594 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	IVY1	Q04934	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	PHO92	Q06390	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YOL050C	YOL050C	GRS2	Q06817	618 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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