RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	FIG1	P38224	298 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TSC10	P38342	320 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FMO1	P38866	432 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FAA3	P39002	694 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FET5	P43561	622 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GPG1	P53130	126 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MAL12	P53341	584 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TIM10	P87108	93 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YPL034W	Q03083	165 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YDR248C	Q03786	193 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YDR249C	Q03787	373 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YMR155W	Q03795	547 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ATC1	Q04005	294 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YPR127W	Q06494	345 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TRE1	Q08919	783 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ISN1	Q99312	450 aa		5.43	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.42	□□□□□ -1.54	not detected
VBA1	YMR088C	MAS1	P10507	462 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RHB1	P25378	209 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DAL3	P32459	195 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	STB5	P38699	743 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SPC97	P38863	823 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AIM46	P38885	310 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YER085C	P40058	173 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	COS4	P43542	379 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RMD8	P43620	662 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SIP4	P46954	829 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RPE1	P46969	238 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	COS5	P47187	383 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MRX6	P48564	524 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YGR117C	P53270	476 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	COS1	P53822	381 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DID2	P69771	204 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CTF19	Q02732	369 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	UME1	Q03010	460 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CSN9	Q03981	162 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MSC3	Q05812	728 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CDA2	Q06703	312 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ZEO1	Q08245	113 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	TMA16	Q08687	178 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	INP53	Q12271	1107 aa		5.42	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MET17	P06106	444 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ERR1	P0CX10	437 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ERR2	P0CX11	437 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ADY2	P25613	283 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.41	□□□□□ -1.54	not detected
VBA1	YMR088C	MET22	P32179	357 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NDI1	P32340	513 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PET127	P32606	800 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SRB2	P34162	210 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ALY1	P36117	915 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YBP1	P38315	674 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NVJ1	P38881	321 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	VMA7	P39111	118 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YIL165C	P40446	119 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	GTT1	P40582	234 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SWP82	P43554	623 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YFR018C	P43599	363 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YJL016W	P47072	561 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	COG1	P53079	417 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SLD3	P53135	668 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	IMO32	P53219	342 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SHY1	P53266	389 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YNR040W	P53736	256 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	CAF40	P53829	373 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SOV1	Q04748	898 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	VID22	Q05934	901 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MFG1	Q07684	458 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RAX1	Q08760	435 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ULA1	Q12059	462 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MLH3	Q12083	715 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AGC1	Q12482	902 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	KRE5	P22023	1365 aa		5.41	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AGP1	P25376	633 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.8 ms