RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ATP12	P22135	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PDE1	P22434	369 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PEX1	P24004	1043 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PEX34	P25584	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	KAR9	P32526	644 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	GCS1	P35197	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YSW1	P38280	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	VPS41	P38959	992 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YIR016W	P40572	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SIP4	P46954	829 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	NUP84	P52891	726 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TAF6	P53040	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	AIM14	P53109	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PEX8	P53248	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YGR127W	P53275	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	IPI3	P53877	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	DOS2	P54858	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	BET4	Q00618	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PIR3	Q03180	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	USA1	Q03714	838 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	CDC123	Q05791	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ATG33	Q06485	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	USV1	Q12132	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
CPR4	YCR069W	AFI1	Q99222	893 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SEM1	O94742	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HMG1	P12683	1054 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
CPR4	YCR069W	APE1	P14904	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PPH22	P23595	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YSP3	P25036	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PCL2	P25693	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	CSE1	P33307	960 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ETR1	P38071	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YBR056W	P38081	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	STN1	P38960	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MNN1	P39106	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YNL195C	P40168	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MEP1	P40260	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	ATM1	P40416	690 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MAF1	P41910	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PET130	P47065	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SWC7	Q06707	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SPE4	Q12455	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MRPL8	P22353	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MNE1	P24720	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	GID7	P25569	745 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YCL068C	P25593	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	COY1	P34237	679 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TOM20	P35180	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	STB6	P36085	766 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MRP21	P38175	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SIF2	P38262	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YEL020C	P39994	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HEM14	P40012	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	FLC3	P53121	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TGL2	P54857	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SPP2	Q02521	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PET117	Q02771	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	CCE1	Q03702	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SEG1	Q04279	960 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	NTG2	Q08214	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PEX15	Q08215	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MPD2	Q99316	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RPN13	O13563	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	REV1	P12689	985 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PHA2	P32452	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TFC3	P34111	1160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HSM3	P38348	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RPH1	P39956	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	HAT2	P39984	401 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RGI2	P40188	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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