RNA–Protein interactions for RNA: YBR114W

RAD16, Transcript of Nucleotide excision repair (NER) protein, yeast

Gene RAD16, Length 2,373 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD16	YBR114W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	MRP13	P12686	339 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	POL3	P15436	1097 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	AAC3	P18238	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	RGR1	P19263	1082 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	HCM1	P25364	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	ATP7	P30902	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	TGL4	P36165	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	TSC10	P38342	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	UBX7	P38349	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	SPC97	P38863	823 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PNT1	P38969	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	MSS2	P40990	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	RRN7	P40992	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YJR154W	P47181	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	FMP48	P53233	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	RCN2	Q12044	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	DCS2	Q12123	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YPT6	Q99260	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	ERG12	P07277	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PET54	P10834	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	INO1	P11986	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	VPS33	P20795	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	MIH1	P23748	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	GID7	P25569	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	SEF1	P34228	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PTC1	P35182	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YBP1	P38315	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	RFC3	P38629	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	STB5	P38699	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	HXT14	P42833	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	IRC5	P43610	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	NET1	P47035	1189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	DIE2	P50076	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	UFD1	P53044	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	IMA1	P53051	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	VPS62	P53285	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	SLI1	P53304	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	TNA1	P53322	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	CWC24	P53769	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YNL181W	P53878	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	THI73	Q07904	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	REX4	Q08237	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	TMA17	Q12513	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	PCD1	Q12524	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD16	YBR114W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	GAL2	P13181	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	HOP1	P20050	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	AFT1	P22149	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SED4	P25365	1065 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	EMC1	P25574	760 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NDI1	P32340	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NDC1	P32500	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	ECM25	P32525	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	OSW5	P40219	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NUP82	P40368	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NIT1	P40447	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	CIN1	P40987	1014 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	HXT10	P43581	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	IBA57	P47158	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	PEX12	Q04370	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	THI7	Q05998	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	NSL1	Q12143	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	GTT2	Q12390	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	VCX1	Q99385	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RPN13	O13563	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SPS4	P09937	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	RAM1	P22007	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD16	YBR114W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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