RNA–Protein interactions for RNA: YMR258C

ROY1, Transcript of GTPase inhibitor with similarity to F-box proteins, yeast

Gene ROY1, Length 1,662 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROY1	YMR258C	ENT1	Q12518	454 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	SMC6	Q12749	1114 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	SIN3	P22579	1536 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	CDC16	P09798	840 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	VMA16	P23968	213 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	RAD51	P25454	400 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	MIA40	P36046	403 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	AGP2	P38090	596 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	MAL33	P38157	468 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	YBL029W	P38201	376 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	HXT9	P40885	567 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	LYS14	P40971	790 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	APC5	Q08683	685 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ROY1	YMR258C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	HNM1	P19807	563 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	GAC1	P28006	793 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	BZZ1	P38822	633 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	IRC6	P43615	237 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YJL055W	P47044	245 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	DIA3	P52290	468 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YNL181W	P53878	407 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ZDS2	P54786	942 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	RTT103	Q05543	409 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YPR172W	Q06608	200 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	HUA2	Q12134	243 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	TAH18	Q12181	623 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.59	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	EDE1	P34216	1381 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	DRS2	P39524	1355 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	RED1	P14291	827 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ADH7	P25377	361 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	MGR1	P25573	417 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	POL4	P25615	582 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	IME2	P32581	645 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	BYE1	P36106	594 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YPK3	P38070	525 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	AXL1	P40851	1208 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	MDE1	P47095	244 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	MAK10	Q02197	733 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	SMA1	Q02651	245 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	HOT1	Q03213	719 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ATG26	Q06321	1198 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YDL218W	Q07629	317 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	PLP2	Q12017	286 aa		2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	STF1	P01098	86 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YCK1	P23291	538 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	RAD24	P32641	659 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	PDR3	P33200	976 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	RIB7	P33312	244 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	CAB3	P36076	571 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ANS1	P38832	159 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ELO1	P39540	310 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YIL060W	P40519	144 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
ROY1	YMR258C	RNH1	Q04740	348 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	SCW10	Q04951	389 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	SAC3	P46674	1301 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ARG81	P05085	880 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	PDX1	P16451	410 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	DBF4	P32325	704 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	TSC10	P38342	320 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	DBP8	P38719	431 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	IAH1	P41734	238 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	PTR3	P43606	678 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	CUL3	P53202	744 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ALF1	P53904	254 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	EKI1	Q03764	534 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	MFB1	Q04922	465 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	REX3	Q12090	404 aa		2.57	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		2.56	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		2.56	□□□□□ -2
ROY1	YMR258C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		2.56	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms