RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeastyeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STF2YGR008C SDS24P38314 527 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TDA11P38854 504 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C SPC97P38863 823 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YER130CP39959 443 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C SHR5P41912 237 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C SSU1P41930 458 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C PMT6P42934 759 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C ALG2P43636 503 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C GUF1P46943 645 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YGL242CP53066 181 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C NOG2P53742 486 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C IPI3P53877 555 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C MTQ1P53944 314 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TGL2P54857 326 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C VPS71Q03433 280 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C ENT4Q07872 247 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TEN1Q07921 160 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YLR012CQ07927 99 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C YLR036CQ07986 203 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C VPS68Q12016 184 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C TPO4Q12256 659 aa1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
STF2YGR008C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YJL197C-AP0C5P0 93 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GEX1P25596 615 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C FRE1P32791 686 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C MRS6P32864 603 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C SKN1P33336 771 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C EMC3P36039 253 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PRY2P36110 329 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GEX2P36173 615 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C MRPL37P36532 105 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PSY4P38193 441 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PBY1P38254 753 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C TDA3P38758 523 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ECM14P38836 430 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C MET30P39014 640 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GET2P40056 285 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C LRO1P40345 661 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YIL012WP40551 113 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GDS1P41913 522 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C CUE3P53137 624 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C MKC7P53379 596 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C VPS36Q06696 566 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YLR001CQ07895 862 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PLB3Q08108 686 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C APL5Q08951 932 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C THI21Q08975 551 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C DIN7Q12086 430 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YLR046CQ12253 270 aa1.21□□□□□ -2.22
STF2YGR008C TPK2P06245 380 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C CHS1P08004 1131 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C SRD1P09007 221 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ASP3-2P0CX77 362 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ASP3-3P0CX78 362 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ASP3-4P0CX79 362 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ASP3-1P0CZ17 362 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GSY2P27472 705 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YOX1P34161 385 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ASK1P35734 292 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C AGP2P38090 596 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C SET5P38890 526 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C SPT8P38915 602 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data1.2□□□□□ -2.22not detected
STF2YGR008C DSE1P40077 573 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C MNT3P40549 630 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C VMA13P41807 478 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C CUP9P41817 306 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GLG2P47011 380 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C NIT3P49954 291 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C TRM9P49957 279 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C TEP1P53916 434 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C ERG13P54839 491 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YPS7Q06325 596 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C SHS1Q07657 551 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C BUD7Q08754 746 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C NBP2Q12163 236 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C STT4P37297 1900 aa1.2□□□□□ -2.22
STF2YGR008C FOB1O13329 566 aa1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GLN4P13188 809 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C DAL81P21657 970 aa1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C OPI1P21957 404 aa1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C RPI1P23250 407 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GFD2P25370 566 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PMT2P31382 759 aa1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PET309P32522 965 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C YHR033WP38690 423 aa1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C SIP3P38717 1229 aa1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C GND1P38720 489 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
STF2YGR008C PCI8P40512 444 aa1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms