RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	PSD1	P39006	500 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	FMP10	P40098	244 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	ALT2	P52892	507 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	MRPL13	Q02204	264 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	RRN11	Q04712	507 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	FAB1	P34756	2278 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	MTF2	P10849	440 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	PHO81	P17442	1178 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	IFA38	P38286	347 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	HAT2	P39984	401 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	ARK1	P53974	638 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	PBA1	Q05778	276 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	PEP5	P12868	1029 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	CLN3	P13365	580 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	FRE1	P32791	686 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
VAR1	Q0140	SNG1	P46950	547 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	DUG3	P53871	357 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	MUB1	Q03162	620 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	VPS74	Q06385	345 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	RTT109	Q07794	436 aa		2.92	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	YIL067C	P40514	678 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	SHR3	Q02774	210 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	TEN1	Q07921	160 aa		2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
VAR1	Q0140	MRP4	P32902	394 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	DIA3	P52290	468 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	IRC15	Q02733	499 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	CIA1	Q05583	330 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	SKG3	Q06315	1026 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	TFC6	Q06339	672 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RBD2	Q12270	262 aa		2.9	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YLR302C	O13544	120 aa		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	MSM1	P22438	575 aa		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YKL100C	P34248	587 aa		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	GRX7	P38068	203 aa		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	SLD5	Q03406	294 aa		2.89	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ACA1	P39970	489 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	SLZ1	P40167	298 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	REE1	P40893	198 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	BUD32	P53323	261 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	PSR1	Q07800	427 aa		2.88	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	HEM15	P16622	393 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.87	□□□□□ -1.95	not detected
VAR1	Q0140	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YCR007C	P25354	239 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RIC1	P40395	1056 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	MRPL35	Q06678	367 aa		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ADH7	P25377	361 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	SGF29	P25554	259 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YFL067W	P43537	175 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YJR154W	P47181	346 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ESA1	Q08649	445 aa		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ATP4	P05626	244 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	HIP1	P06775	603 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	SHY1	P53266	389 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RCO1	Q04779	684 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	IVY1	Q04934	453 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	BLS1	Q06071	122 aa		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	EXO70	P19658	623 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	VMA16	P23968	213 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ALY1	P36117	915 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	ELP2	P42935	788 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	GWT1	P47026	490 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	YMR027W	Q04371	470 aa		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	Q0140	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	XRS2	P33301	854 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	CNS1	P33313	385 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	PTR3	P43606	678 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	DSD1	P53095	428 aa		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	CHS1	P08004	1131 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	SYN8	P31377	255 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	UTR4	P32626	227 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	UME6	P39001	836 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	CAF40	P53829	373 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	PIR3	Q03180	325 aa		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.82	□□□□□ -1.96	not detected
VAR1	Q0140	SUC2	P00724	532 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	CPR4	P25334	318 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	BOS1	P25385	244 aa		2.81	□□□□□ -1.96

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