RNA–Protein interactions for RNA: YNL293W

MSB3, Transcript of Rab GTPase-activating protein, yeast

Gene MSB3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSB3	YNL293W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	AIM14	P53109	570 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	COG5	P53951	403 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CWC27	Q02770	301 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RSN1	Q03516	953 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	SAS4	Q04003	481 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	GAL83	Q04739	417 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	SNA4	Q07549	140 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	FRE3	Q08905	711 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YPR063C	Q12160	140 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	HAT1	Q12341	374 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	KAP122	P32767	1081 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MCD4	P36051	919 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.07	□□□□□ -1.28	not detected
MSB3	YNL293W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NVJ1	P38881	321 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	STL1	P39932	569 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RRN7	P40992	514 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NNF1	P47149	201 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PMT5	P52867	743 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	VPS62	P53285	467 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	LSC2	P53312	427 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	EEB1	Q02891	456 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YDR387C	Q04162	555 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CIA1	Q05583	330 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	HDA3	Q06623	655 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MCH5	Q08777	521 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YPR202W	Q08993	238 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	DIN7	Q12086	430 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	BCK1	Q01389	1478 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ARG82	P07250	355 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	SED4	P25365	1065 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RRT12	P25381	491 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CTS1	P29029	562 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RPD3	P32561	433 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	TGL4	P36165	910 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	POP4	P38336	279 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PLB1	P39105	664 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CST9	Q06032	482 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ECM7	Q06200	448 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YDL086W	Q07505	273 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ATG20	Q07528	640 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ZEO1	Q08245	113 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YPL216W	Q08964	1102 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	THI21	Q08975	551 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	GRX6	Q12438	231 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	STF1	P01098	86 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	COX4	P04037	155 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MET17	P06106	444 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MGR1	P25573	417 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	HEM3	P28789	327 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PTP2	P29461	750 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NDI1	P32340	513 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MAL32	P38158	584 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	UBX7	P38349	436 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	BZZ1	P38822	633 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RFC2	P40348	353 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NUP82	P40368	713 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CCC1	P47818	322 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PAC10	P48363	199 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ORC5	P50874	479 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MLC1	P53141	149 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MAL12	P53341	584 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CSN9	Q03981	162 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	VID22	Q05934	901 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	LAP2	Q10740	671 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	TY3A-G	Q12173	290 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YOR342C	Q12182	319 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	GIS3	Q12418	502 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	TY3A-I	Q99219	290 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NUP192	P47054	1683 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	CBF1	P17106	351 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	AMS1	P22855	1083 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PPH22	P23595	377 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	ECM25	P32525	599 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	MKS1	P34072	584 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YBR137W	P38276	179 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	AIM18	P38884	321 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	TIR3	P40552	269 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	SPO74	P45819	413 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	YJR056C	P47115	236 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	PPT1	P53043	513 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MSB3	YNL293W	IMA1	P53051	589 aa		7.05	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms