RNA–Protein interactions for RNA: YGL006W

PMC1, Transcript of Vacuolar Ca2+ ATPase involved in depleting cytosol of Ca2+ ions, yeast

Gene PMC1, Length 3,522 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMC1	YGL006W	MRPL17	P36528	281 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ARN1	P38731	627 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	GOS1	P38736	223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	VAB2	P40003	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SOK1	P40317	901 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	LAS21	P40367	830 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	FET5	P43561	622 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	PFD1	P46988	109 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ALT1	P52893	592 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	NCS6	P53088	359 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	UGO1	Q03327	502 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	PEX29	Q03370	554 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RAD33	Q04231	177 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	HMG2	P12684	1045 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	NIC96	P34077	839 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ARA1	P38115	344 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	IST2	P38250	946 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YAR028W	P39548	234 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	IMA5	P40884	581 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	AGP3	P43548	558 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	MET13	P53128	600 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	HEH2	Q03281	663 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	DML1	Q03652	475 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	CUR1	Q06469	252 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	HOS1	Q12214	470 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	GRR1	P24814	1151 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RER1	P25560	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	VBA3	P25594	458 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	CSM1	P25651	190 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	FUN30	P31380	1131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	VBA5	P36172	582 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ECM13	P38195	257 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	MLH1	P38920	769 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	XDJ1	P39102	459 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ACA1	P39970	489 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	COG3	P40094	801 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RRT5	P43607	289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	MND1	P53102	219 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SPC98	P53540	846 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ISU1	Q03020	165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SKY1	Q03656	742 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	HDA3	Q06623	655 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	COS7	Q07788	383 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RCN2	Q12044	265 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	RPN6	Q12377	434 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SAS5	Q99314	248 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	IZH4	Q99393	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	STB6	P36085	766 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	MRPL7	P36519	292 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	AGP2	P38090	596 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	AIM7	Q12156	149 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	NBP2	Q12163	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SNF8	Q12483	233 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	FLO1	P32768	1537 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	HO	P09932	586 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	CAP2	P13517	287 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ATP12	P22135	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YSP3	P25036	478 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	UTR4	P32626	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SRP101	P32916	621 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SKG1	P36169	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	REG2	P38232	338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	LEU5	P38702	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SNX4	P47057	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	YAT1	P80235	687 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	NRT1	Q08485	598 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PMC1	YGL006W	FLO11	P08640	1367 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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