RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439369.6

SCLT1-202, Transcript of sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCLT1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1-202ENST00000439369 MAP2K2P36507 400 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 PKN1Q16512 942 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 PIGSQ96S52 555 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 ALG1Q9BT22 464 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 AMNQ9BXJ7 453 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 MAF1Q9H063 256 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 CPVLQ9H3G5 476 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.65□□□□□ -0.06
SCLT1-202ENST00000439369 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ALDH1A1P00352 501 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ICAM1P05362 532 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 HERVK_113P62684 666 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 FBXO11Q86XK2 927 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 IFNL1Q8IU54 200 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ATG4CQ96DT6 458 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 DDX11Q96FC9 970 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 BARHL2Q9NY43 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ESYT2A0FGR8 921 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 HSPA6P17066 643 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 COPB2P35606 906 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 C1QTNF8P60827 252 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 TRIM29Q14134 588 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 TKFCQ3LXA3 575 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 GALNT17Q6IS24 598 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 HOMER1Q86YM7 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 REPS2Q8NFH8 660 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PTPN18Q99952 460 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ABCB11O95342 1321 aa14.63□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 STXBP3O00186 592 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CALML3P27482 149 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 DDIT3P35638 169 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SLC4A3P48751 1232 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 C8orf76Q96K31 380 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ZNF536O15090 1300 aa14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 MCTP2Q6DN12 878 aa14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.61□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 MYH6P13533 1939 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SLC25A27O95847 323 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SYT1P21579 422 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 GNA11P29992 359 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 NAPAP54920 295 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 BICD2Q8TD16 824 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 H3BQV1 296 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 STX6O43752 255 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 PPFIA3O75145 1194 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 MMP1P03956 469 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 STAT3P40763 770 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 VEGFBP49765 207 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CCNA1P78396 465 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 NUCB2P80303 420 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 GHRHRQ02643 423 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 IFFO2Q5TF58 517 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 KRT40Q6A162 431 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 CCDC174Q6PII3 467 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.59□□□□□ -0.07
SCLT1-202ENST00000439369 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms