RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	COX16	P47081	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YJR124C	P47159	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MRPL50	P53724	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SHE9	Q04172	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	GGA1	Q06336	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SGO1	Q08490	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PEX11	Q12462	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ATP12	P22135	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CLB4	P24871	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	NTH1	P32356	751 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	STE13	P33894	931 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PIM1	P36775	1133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YSW1	P38280	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	LEM3	P42838	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	AMA1	P50082	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CLD1	P53264	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YAP1802	P53309	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ASI1	P54074	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	APC9	Q12107	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	BET2	P20133	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	NAM9	P27929	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	GDH3	P39708	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	FRT2	P39734	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RRN7	P40992	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TAF6	P53040	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CDC123	Q05791	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MCD1	Q12158	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
PDR10	YOR328W	SLP1	Q12232	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SPS1	P08458	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	GIP1	P38229	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PET100	P38958	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	DUN1	P39009	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	AIM14	P53109	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RSB1	Q08417	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TRP3	P00937	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PPH22	P23595	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	VPS51	P36116	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PIR3	Q03180	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	INP2	Q03824	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ATG15	P25641	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	STB6	P36085	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PCL5	P38794	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YHR182W	P38870	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	EFM3	P47163	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SWC4	P53201	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	TFB2	Q02939	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SUC2	P00724	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	GAL4	P04386	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MSF1	P08425	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	OXP1	P28273	1286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MRPL36	P36531	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SAE2	P46946	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SLG1	P54867	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	GRX8	Q05926	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	OPI10	Q08202	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	IMA2	Q08295	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	FEX2	Q08991	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	MDY2	Q12285	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SPE4	Q12455	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	CDC20	P26309	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YKL075C	P36083	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
PDR10	YOR328W	CCZ1	P38273	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	FHL1	P39521	936 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	PAC11	P40960	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	YJL107C	P42947	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PDR10	YOR328W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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