RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W REC107P21651 314 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YSP3P25036 478 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W ADK2P26364 225 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W RPC34P32910 317 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W GCS1P35197 352 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W STB6P36085 766 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W MNN2P38069 597 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W CST26P38226 397 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W SPC97P38863 823 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W CCT6P39079 546 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W SAP1P39955 897 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.6□□□□□ -1.83not detected
SNX4YJL036W SNO3P43544 222 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W MSY1P48527 492 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W ART5P53244 586 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W JJJ1P53863 590 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W CIK1Q01649 594 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YDR239CQ03780 787 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W PLM2Q04383 521 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W AIM32Q04689 311 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W VPS38Q05919 439 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YPL191CQ08930 360 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W ATG29Q12092 213 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W LCB4Q12246 624 aa3.6□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W GAL80P04387 435 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W SEF1P34228 1148 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W LHS1P36016 881 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W APE3P37302 537 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W MRX1P40050 688 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W DIA3P52290 468 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W NNF2P53253 936 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W RSM28Q03430 361 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W WAR1Q03631 944 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YLR345WQ06137 509 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W AVL9Q12500 764 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YML133CQ03099 1374 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YLL067CQ07888 1374 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W YLL066CQ99208 1374 aa3.59□□□□□ -1.83
SNX4YJL036W MF(ALPHA)1P01149 165 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W NAT1P12945 854 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MNE1P24720 663 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W CLB1P24868 471 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ADH7P25377 361 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W DPH2P32461 534 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RXT2P38255 430 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ECM10P39987 644 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ALG5P40350 334 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ASG1P40467 964 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W LCB2P40970 561 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ZIM17P42844 174 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PET130P47065 347 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YGR016WP53209 190 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W VPS9P54787 451 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MAK10Q02197 733 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MEH1Q02205 184 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W GYL1Q04322 720 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PCL8Q08966 492 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YPL272CQ08984 517 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SGS1P35187 1447 aa3.58□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PCT1P13259 424 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PDA1P16387 420 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W STE50P25344 346 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YCR051WP25631 222 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ANP1P32629 500 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MDL1P33310 695 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PCI8P40512 444 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YJL055WP47044 245 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W BTN2P53286 410 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W IST1P53843 298 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W IPI3P53877 555 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RAD33Q04231 177 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W INP53Q12271 1107 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.57□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W AQY1P0CD91 305 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W TFB1P32776 642 aa3.56□□□□□ -1.84
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