RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	PDR3	P33200	976 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	LHS1	P36016	881 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ESL2	P36168	1195 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	BZZ1	P38822	633 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SGF73	P53165	657 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	MCP2	Q06567	569 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	NYV1	Q12255	253 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	COX17	Q12287	69 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	PSK1	P31374	1356 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ATP4	P05626	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SPO16	P17122	198 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	NUP120	P35729	1037 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	CTK2	P46962	323 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YTP1	P53584	459 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YNL181W	P53878	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YML133C	Q03099	1374 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TAH18	Q12181	623 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	MRX1	P40050	688 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	PSF2	P40359	213 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	COG1	P53079	417 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	EKI1	Q03764	534 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ARP10	Q04549	284 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	CIA1	Q05583	330 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TMA16	Q08687	178 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TIP41	Q12199	356 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	EDE1	P34216	1381 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	RAP1	P11938	827 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	BAR1	P12630	587 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	RAD24	P32641	659 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ECM10	P39987	644 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YFR020W	P43600	232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	RSM28	Q03430	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	BSC1	Q12140	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	PHO81	P17442	1178 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SPE2	P21182	396 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YCL049C	P25577	312 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YPK3	P38070	525 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ACA1	P39970	489 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ATG27	P46989	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	SCW10	Q04951	389 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	RTT103	Q05543	409 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	NUC1	P08466	329 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	CLB2	P24869	491 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	IFA38	P38286	347 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	ASE1	P50275	885 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	CUL3	P53202	744 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PEX18	YHR160C	TPK1	P06244	397 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	MSM1	P22438	575 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	SRB5	P32585	307 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	MRPL36	P36531	177 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	NPR3	P38742	1146 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RTS2	P40962	232 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	FCP1	Q03254	732 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RPB8	P20436	146 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	TRS65	P32893	560 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	STV1	P37296	890 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YJL070C	P40361	888 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YIL060W	P40519	144 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	FET5	P43561	622 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YNR061C	P53747	219 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YLR352W	Q06479	807 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	ENT1	Q12518	454 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	IAH1	P41734	238 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	RSF1	Q05043	376 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	YOL057W	Q08225	711 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.5	□□□□□ -1.85
PEX18	YHR160C	MHP1	P43638	1398 aa		3.5	□□□□□ -1.85

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