RNA–Protein interactions for RNA: YKR085C

MRPL20, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL20, Length 588 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL20	YKR085C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	SND1	Q04007	877 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPL20	YKR085C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	NFS1	P25374	497 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	NAM9	P27929	486 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	MRP4	P32902	394 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	TOD6	P34219	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YPT53	P36019	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PTC7	P38797	343 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GPI16	P38875	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	LYS9	P38999	446 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YER130C	P39959	443 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SSU1	P41930	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	RTS3	P53289	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	INP2	Q03824	705 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	HUA2	Q12134	243 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PRI2	P20457	528 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	NPR1	P22211	790 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	IMG1	P25626	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	ATG15	P25641	520 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SPC110	P32380	944 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YHL041W	P38730	149 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	STN1	P38960	494 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YEL028W	P39989	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	CIR1	P42940	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GAT1	P43574	510 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PCL10	P53124	433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	TIM13	P53299	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	FDC1	Q03034	503 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PNP1	Q05788	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PGC1	Q08959	321 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	THI21	Q08975	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	MCD1	Q12158	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	HSP42	Q12329	375 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SEY1	Q99287	776 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	EPT1	P22140	391 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GDA1	P32621	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SKN1	P33336	771 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	MOH1	P38191	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	EXO5	P38289	585 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	FTH1	P38310	465 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YHR182W	P38870	785 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	CYC2	P38909	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	LRO1	P40345	661 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	ARP4	P80428	489 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	RCO1	Q04779	684 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GAD1	Q04792	585 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GRX8	Q05926	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	TGL5	Q12043	749 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	STT4	P37297	1900 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	PUT4	P15380	627 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	TUP1	P16649	713 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GAL11	P19659	1081 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	ADH7	P25377	361 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	DCC1	P25559	380 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	APL1	P27351	700 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	ALY1	P36117	915 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GMH1	P36125	273 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	FUI1	P38196	639 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GIC1	P38785	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YIL054W	P40524	105 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	GTS1	P40956	396 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SNZ3	P43545	298 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	YJL132W	P47014	750 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	SNZ2	P53824	298 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	IPI3	P53877	555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	MDM30	Q05930	598 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	COG4	Q06096	861 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRPL20	YKR085C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.9 ms