RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ALR2	P43553	858 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	STB2	P46679	850 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ASK10	P48361	1146 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SLI1	P53304	468 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YNL115C	P53925	644 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ASI1	P54074	624 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YFT2	Q06676	274 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ESA1	Q08649	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HFI1	Q12060	488 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	TIP41	Q12199	356 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	UBX3	Q12229	455 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	INP53	Q12271	1107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	TOP3	P13099	656 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GIT1	P25346	518 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HCS1	P34243	683 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	WSS1	P38838	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ICE2	P40499	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
NUP133	YKR082W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PET117	Q02771	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ARG7	Q04728	441 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MTR10	Q99189	972 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SEC63	P14906	663 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ADE1	P27616	306 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SMF1	P38925	575 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SAK1	P38990	1142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YJR056C	P47115	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MRX6	P48564	524 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YGL138C	P53122	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MRPL50	P53724	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GCN5	Q03330	439 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RCO1	Q04779	684 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CBS1	P14066	229 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	NMT1	P14743	455 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ALG1	P16661	449 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SEC62	P21825	274 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PRE8	P23639	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PEX3	P28795	441 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MAC1	P35192	417 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	IFA38	P38286	347 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MUP3	P38734	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
NUP133	YKR082W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RTS2	P40962	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	OKP1	P53298	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SLT2	Q00772	484 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	INA17	Q02888	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	URH1	Q04179	340 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	UBX2	Q04228	584 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	THI22	Q06490	572 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	REX4	Q08237	289 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RDR1	Q08904	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CTI6	Q08923	506 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HUA2	Q12134	243 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	KIN3	P22209	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RPC34	P32910	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YKL070W	P36087	169 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	JLP2	P40206	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	FMC1	P40491	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RRN7	P40992	514 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	BSC5	P53755	489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	FMP30	Q02883	468 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GIS4	Q04233	774 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SPO77	Q06134	477 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MED2	Q12124	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MSF1	P08425	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RAD18	P10862	487 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
NUP133	YKR082W	SLM1	P40485	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YIL092W	P40497	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ELP2	P42935	788 aa		4.09	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.6 ms