RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	SNO4	Q04902	237 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	ARP9	Q05123	467 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	MCP2	Q06567	569 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	HSP32	Q08992	237 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	IME4	P41833	600 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	VPS4	P52917	437 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	ECI1	Q05871	280 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	NUS1	Q12063	375 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	EDE1	P34216	1381 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	MRP20	P32387	263 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	ALY1	P36117	915 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YER010C	P40011	234 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	PCL6	P40038	420 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YML131W	Q03102	365 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	PDR3	P33200	976 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	GCS1	P35197	352 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	LEU5	P38702	357 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	HXT9	P40885	567 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	SAD1	P43589	448 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	BET4	Q00618	327 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	RPB8	P20436	146 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	CLB2	P24869	491 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	FMP10	P40098	244 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	ARP10	Q04549	284 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RSM27	YGR215W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	MGR1	P25573	417 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	STB2	P46679	850 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YNL181W	P53878	407 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	CBK1	P53894	756 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	EKI1	Q03764	534 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	FMP42	Q04991	504 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	SSP2	Q08646	371 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	BUR6	P40096	142 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YIL060W	P40519	144 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	SMA1	Q02651	245 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RCO1	Q04779	684 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	NRT1	Q08485	598 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	ATG9	Q12142	997 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YUR1	P26725	428 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RRN3	P36070	627 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	SLZ1	P40167	298 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	PKP1	P40530	394 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	MAK10	Q02197	733 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	MUB1	Q03162	620 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	GRS2	Q06817	618 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	ENT4	Q07872	247 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	INP53	Q12271	1107 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YPK3	P38070	525 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	EFM2	P38347	419 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	ANS1	P38832	159 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YND1	P40009	630 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YAT2	P40017	923 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YJR061W	P40355	935 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	MAF1	P41910	395 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	INN1	P53901	409 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	NDD1	Q08887	554 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	APL4	Q12028	832 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	NBP2	Q12163	236 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	HNM1	P19807	563 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	CBF2	P32504	956 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RTS2	P40962	232 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	PKP2	P53170	491 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	PSR1	Q07800	427 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	SPE2	P21182	396 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RER1	P25560	188 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	RAD24	P32641	659 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	YKL050C	P35736	922 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	MIA40	P36046	403 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	BZZ1	P38822	633 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RSM27	YGR215W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79

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