RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W COS4P43542 379 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CIT3P43635 486 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YJL016WP47072 561 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W COS5P47187 383 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W TAF6P53040 516 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YGR127WP53275 312 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SNF12P53628 566 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W HXT17P53631 564 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W COS1P53822 381 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GIM5Q04493 163 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W FRE5Q08908 694 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W KIN28P06242 306 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MATALPHA1P0CY06 175 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HMLALPHA1P0CY07 175 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SPO16P17122 198 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CAD1P24813 409 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MCM4P30665 933 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W THI4P32318 326 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GDH3P39708 457 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RSP5P39940 809 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GTT1P40582 234 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SPO74P45819 413 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MSE1P48525 536 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TWF1P53250 332 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TAF9Q05027 157 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DCR2Q05924 578 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YOL019WQ08157 551 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TY3A-GQ12173 290 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MDM12Q92328 271 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W TY3A-IQ99219 290 aa5.15□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YLR358CO13565 187 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GPH1P06738 902 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GPA1P08539 472 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PRB1P09232 635 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CBF1P17106 351 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SCT1P32784 759 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CDC13P32797 924 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W NIC96P34077 839 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W OAF3P36023 863 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W UTP30P36144 274 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HMT1P38074 348 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YHR202WP38887 602 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SMF1P38925 575 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PCL6P40038 420 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PSA1P41940 361 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CCT7P42943 550 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HDA1P53973 706 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DID2P69771 204 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W PLM2Q04383 521 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W URC2Q04411 772 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FAR10Q06001 478 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VTA1Q06263 330 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W HOS1Q12214 470 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W LDB17Q12342 491 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W FMP16Q12497 93 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BUD3P25558 1636 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ULS1Q08562 1619 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ABF1P14164 731 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RNR3P21672 869 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CTR86P25355 563 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPT5P33297 434 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VAB2P40003 282 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RGI2P40188 164 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPC17P47076 161 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W LIA1P47120 325 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YJR098CP47139 656 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W CCC1P47818 322 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W KTR6P54070 446 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MET14Q02196 202 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ECM23Q02710 187 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ARL3Q02804 198 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W YDR239CQ03780 787 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RCO1Q04779 684 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W VPS38Q05919 439 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RRT8Q08219 342 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BDS1Q08347 646 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W DGK1Q12382 290 aa5.14□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W AI2P03876 854 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MET2P08465 486 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W GFA1P14742 717 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W MIP1P15801 1254 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W APA1P16550 321 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W BAS1P22035 811 aa5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W RPS5P26783 225 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CYK3YDL117W SPT14P32363 452 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.7 ms