RNA–Protein interactions for RNA: YMR111C

YMR111C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YMR111C, Length 1,389 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR111C	YMR111C	OPY2	Q06810	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	YCR015C	P25616	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	BRF1	P29056	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	FRE1	P32791	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	JNM1	P36224	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	MRPL40	P36534	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	SUN4	P53616	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	GPR1	Q12361	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	ALG1	P16661	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	HOP1	P20050	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	FET5	P43561	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	GUF1	P46943	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	AIM23	P47015	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	BNA2	P47125	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	MUB1	Q03162	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RSB1	Q08417	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	INH1	P01097	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	DAL82	P21705	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	YCL002C	P25565	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	SEC65	P29478	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	SGE1	P33335	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	ECM13	P38195	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	UBS1	P38290	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	CHS7	P38843	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	UFE1	P41834	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	SRB7	P47822	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	SWS2	P53937	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	ARP5	P53946	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	YFT2	Q06676	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	NBP2	Q12163	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	RKM5	Q12367	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YMR111C	YMR111C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR111C	YMR111C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	MSH1	P25846	959 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	SDS22	P36047	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	YHL012W	P38709	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	SAW1	P39735	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	DSE1	P40077	573 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	FTR1	P40088	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	CEP3	P40969	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	SMC3	P47037	1230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	YJR054W	P47114	497 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	RTC4	P53850	401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	AQR1	P53943	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	TRM82	Q03774	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	CRR1	Q05790	422 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	BLS1	Q06071	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	SVS1	Q12254	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	PNS1	Q12412	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	CYM1	P32898	989 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	PEX7	P39108	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	TMA108	P40462	946 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	MNT3	P40549	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	DSN1	P40568	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	THI6	P41835	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	ASK10	P48361	1146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	HFM1	P51979	1187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	UBA2	P52488	636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	ZIP2	P53061	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	PCL10	P53124	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	TEP1	P53916	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	BNA5	Q05979	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YMR111C	YMR111C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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