RNA–Protein interactions for RNA: YLR066W

SPC3, Transcript of Subunit of signal peptidase complex, yeast

Gene SPC3, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC3	YLR066W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RTS1	P38903	757 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SWP82	P43554	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	TCO89	Q08921	799 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	NMD4	Q12129	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ADY2	P25613	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	LHS1	P36016	881 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	AGP2	P38090	596 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	IRC6	P43615	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SPC19	Q03954	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RAD34	Q06665	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SUT2	Q12286	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	YCK1	P23291	538 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	YBR225W	P38321	900 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SAE2	P46946	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	FMP30	Q02883	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	PSR1	Q07800	427 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	CTI6	Q08923	506 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RCN2	Q12044	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	TAH18	Q12181	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	KAR3	P17119	729 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	FTH1	P38310	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	JHD1	P40034	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	VPS75	P53853	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	TIM10	P87108	93 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	RSM28	Q03430	361 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MFB1	Q04922	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	GSH1	P32477	678 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MAL33	P38157	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	UIP3	P39547	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ECM10	P39987	644 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	PKP1	P40530	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
SPC3	YLR066W	SGM1	P47166	707 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MRPL19	P53875	158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	NGL3	Q03210	505 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ARP9	Q05123	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	BSP1	Q06604	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	THI3	Q07471	609 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	SCM3	Q12334	223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	VMA16	P23968	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	OCA4	P25366	362 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	PGS1	P25578	521 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	NPR2	P39923	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MRX6	P48564	524 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	DSD1	P53095	428 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	ARO10	Q06408	635 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	CIR2	Q08822	631 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC3	YLR066W	MAK32	P23060	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YIH1	P25637	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	UBP13	P38187	747 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	CTK2	P46962	323 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	GLO1	P50107	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YML037C	Q03703	340 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	IRC3	Q06683	689 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ADH7	P25377	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	MSS51	P32335	436 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	PPZ2	P33329	710 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	HOT13	P36078	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	RGI2	P40188	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	CDC1	P40986	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	RMD8	P43620	662 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	SMC3	P47037	1230 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ORC5	P50874	479 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	YGR066C	P53242	292 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	TAF11	Q04226	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	INP53	Q12271	1107 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC3	YLR066W	CBS1	P14066	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms