RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	CAB2	P40506	365 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	TAM41	P53230	385 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	PDR8	Q06149	701 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	GSH2	Q08220	491 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PEX18	YHR160C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	SIR1	P21691	654 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	URK1	P27515	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	SWC3	P31376	625 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	HES1	P35843	434 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	VPS41	P38959	992 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MAF1	P41910	395 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	UBX6	P47049	396 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	PEX8	P53248	589 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	DSE3	Q08729	430 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	SUL2	Q12325	893 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	BCK1	Q01389	1478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	FKS3	Q04952	1785 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	POL3	P15436	1097 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	RIT1	P23796	513 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	OCT1	P35999	772 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	TEP1	P53916	434 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MAK10	Q02197	733 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MLH2	Q07980	695 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	NDD1	Q08887	554 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	STP3	Q05937	343 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MCH4	Q08268	501 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YCR006C	P25350	157 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	RGT1	P32862	1170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	APM3	P38153	483 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MET30	P39014	640 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	BUD16	P39988	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	ATG21	Q02887	496 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	PIG1	Q06216	648 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	FRE3	Q08905	711 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	RAV1	P47104	1357 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YAT2	P40017	923 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	YIL169C	P40442	995 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	MSY1	P48527	492 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	GTB1	Q04924	702 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	HIM1	Q06674	414 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	GPA1	P08539	472 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	PET122	P10355	254 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	QRI7	P43122	407 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	VPS25	P47142	202 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	IZH1	Q03419	316 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PEX18	YHR160C	PCT1	P13259	424 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	YSP3	P25036	478 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	SPC72	P39723	622 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	HIS6	P40545	261 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	MET14	Q02196	202 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	NRT1	Q08485	598 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	KRE5	P22023	1365 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	GAL1	P04385	528 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	PIF1	P07271	859 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	MSS18	P08593	268 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	YKL133C	P36066	463 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	SKP2	P42843	763 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	RIM15	P43565	1770 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
PEX18	YHR160C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.69	□□□□□ -1.82

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