RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C NPA3P47122 385 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SOL4P53315 255 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MDM1Q01846 1127 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C NSE5Q03718 556 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VPS20Q04272 221 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RBA50Q04418 439 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C POB3Q04636 552 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SUE1Q06524 206 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PSK2Q08217 1101 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C DSE3Q08729 430 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01 RIP-Chip
GCN4YEL009C GSC2P40989 1895 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C AAC1P04710 309 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C BIK1P11709 440 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CBP3P21560 335 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C FMP46P36141 133 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RXT2P38255 430 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ERG7P38604 731 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TOM71P38825 639 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C NDT80P38830 627 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YEL025CP39991 1188 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VRG4P40107 337 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TPM2P40414 161 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TES1P41903 349 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C IES1P43579 692 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C LSB1P53281 241 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YNL058CP53947 316 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YMR317WQ04893 1140 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ARR3Q06598 404 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ATX2Q12067 313 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YPL150WQ12152 901 aa2.48□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SAM1P10659 382 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VMA2P16140 517 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PWP2P25635 923 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SEC65P29478 273 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C UTR4P32626 227 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MTC7P32633 139 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TGL1P34163 548 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C GND1P38720 489 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C LRO1P40345 661 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YJR096WP47137 282 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YDL183CP48569 320 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C FMS1P50264 508 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ASE1P50275 885 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PEX14P53112 341 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YGL138CP53122 345 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YGL081WP53156 320 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VTC3Q02725 835 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SPH1Q06160 661 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C GET3Q12154 354 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TY3A-GQ12173 290 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.47□□□□□ -2.01 RIP-Chip
GCN4YEL009C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TY3A-IQ99219 290 aa2.47□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MAK32P23060 363 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SAS3P34218 831 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MCR1P36060 302 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MAL33P38157 468 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FAT1P38225 669 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YHR033WP38690 423 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CKB2P38930 258 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HXT7P39004 570 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C LIF1P53150 421 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C BNI5P53890 448 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YCG1Q06680 1035 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CYK3Q07533 885 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CEX1Q12453 761 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C NBL1Q3E7Y6 73 aa2.46□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CDC26P14724 124 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C THR4P16120 514 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RDS1P25611 832 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C IME2P32581 645 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SHP1P34223 423 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C STT3P39007 718 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C GAA1P39012 614 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C DJP1P40564 432 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HYR1P40581 163 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SAD1P43589 448 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RET3P53600 189 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HST1P53685 503 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SLD5Q03406 294 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C AIM33Q04516 312 aa2.45□□□□□ -2.02
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