RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YGR066C	P53242	292 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	HDA1	P53973	706 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SOV1	Q04748	898 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	UPC2	Q12151	913 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	UBX3	Q12229	455 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ARG1	P22768	420 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ERG8	P24521	451 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PRD1	P25375	712 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RRT2	P38332	387 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YHR033W	P38690	423 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PIH1	P38768	344 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LRO1	P40345	661 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	PXA1	P41909	870 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	EXG2	P52911	562 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	SPP1	Q03012	353 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VAM6	Q07468	1049 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YLL054C	Q12244	843 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RBD2	Q12270	262 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	LDB19	Q12502	818 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPC82	P32349	654 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MRPL16	P38064	232 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CDS1	P38221	457 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	RFC3	P38629	340 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	JHD1	P40034	492 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	BRE2	P43132	505 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ZAP1	P47043	880 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	CGR1	P53188	120 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	AQR1	P53943	586 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YKR011C	Q02209	353 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	YEH1	Q07804	573 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ICL2	Q12031	575 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	NUS1	Q12063	375 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	ATG29	Q12092	213 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	BUG1	Q12191	341 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	VCX1	Q99385	411 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TOP1	YOL006C	MRP10	O75012	95 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	CDC42	P19073	191 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	IME1	P21190	360 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PHO11	P35842	467 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PXL1	P36166	706 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PHO12	P38693	467 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ERC1	P38767	581 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	GSM1	P42950	618 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	YGR045C	P53229	120 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	VPS64	Q03944	604 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PPM1	Q04081	328 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ADY4	Q05955	493 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	TPK2	P06245	380 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ARG82	P07250	355 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	PET122	P10355	254 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	UNG1	P12887	359 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	KSS1	P14681	368 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	SYN8	P31377	255 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	MSN4	P33749	630 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	GLG1	P36143	616 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	MAL33	P38157	468 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	APN2	P38207	520 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	TDP1	P38319	544 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ZRG8	P40021	1076 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	ASG1	P40467	964 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	YIR007W	P40566	764 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	TAF4	P50105	388 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TOP1	YOL006C	YGL242C	P53066	181 aa		3.45	□□□□□ -1.86

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