RNA–Protein interactions for RNA: YLL019C

KNS1, Transcript of Protein kinase involved in negative regulation of PolIII transcription, yeast

Gene KNS1, Length 2,214 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KNS1	YLL019C	ACH1	P32316	526 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PPQ1	P32945	549 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PET10	P36139	283 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	ETR1	P38071	380 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YBP1	P38315	674 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RRT2	P38332	387 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.56	□□□□□ -1.36	not detected
KNS1	YLL019C	FRT2	P39734	528 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PAC11	P40960	533 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	XKS1	P42826	600 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	DAN4	P47179	1161 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SLM3	Q12093	417 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	APM4	Q99186	491 aa		6.56	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	MIH1	P23748	554 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SER3	P40054	469 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	TOK1	P40310	691 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SDS3	P40505	327 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	VHR1	P40522	640 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	IMA5	P40884	581 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	ORC3	P54790	616 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SED5	Q01590	340 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RMT2	Q03305	412 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YMR027W	Q04371	470 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CDC9	P04819	755 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	COR1	P07256	457 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SRD1	P09007	221 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	MRPL33	P20084	86 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RAD14	P28519	371 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	TFC1	P32367	649 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CCL1	P37366	393 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	FMP10	P40098	244 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SKP2	P42843	763 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PCL8	Q08966	492 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	ATG29	Q12092	213 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	DOM34	P33309	386 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SWC5	P38326	303 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	BIT2	P38346	545 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	GOS1	P38736	223 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RMD8	P43620	662 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	VTC4	P47075	721 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	GUP1	P53154	560 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	FDC1	Q03034	503 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	COQ9	Q05779	260 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	WSC3	Q12215	556 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YOL114C	Q12322	202 aa		6.54	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	FLP1	P03870	423 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RAD18	P10862	487 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	MAK31	P23059	88 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SNT1	P25357	1226 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.53	□□□□□ -1.36	not detected
KNS1	YLL019C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	LYP1	P32487	611 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	MNN2	P38069	597 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	RAD55	P38953	406 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YEL068C	P39977	110 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	LTP1	P40347	161 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CSM2	P40465	213 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	ASE1	P50275	885 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	HXT15	P54854	567 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	EAR1	Q03212	550 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	AGE1	Q04412	482 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	COX20	Q04935	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	CDA1	Q06702	301 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	MCH5	Q08777	521 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	YLR053C	Q12026	108 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SWI5	P08153	709 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	HMG2	P12684	1045 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	PDX1	P16451	410 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	STF2	P16965	84 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SFL1	P20134	766 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	VPS3	P23643	1011 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	SMI1	P32566	505 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	GIP1	P38229	639 aa		6.53	□□□□□ -1.36
KNS1	YLL019C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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