RNA–Protein interactions for RNA: YKL160W

ELF1, Transcript of Transcription elongation factor with a conserved zinc finger domain, yeast

Gene ELF1, Length 438 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ELF1	YKL160W	SAE2	P46946	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	AAT1	Q01802	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	ATG21	Q02887	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	HRD3	Q05787	833 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	BSP1	Q06604	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	CYK3	Q07533	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	RIT1	P23796	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	VPS8	P39702	1274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	LTP1	P40347	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	UBX4	P54730	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	PLM2	Q04383	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	ICL2	Q12031	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	SPT7	P35177	1332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	USO1	P25386	1790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	SIP1	P32578	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	SPC72	P39723	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	BST1	P43571	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	IMA1	P53051	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	YML053C	Q04978	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	MDM10	P18409	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	BEM3	P32873	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	TPM2	P40414	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ELF1	YKL160W	BIK1	P11709	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	XBP1	P40489	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SNO3	P43544	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	TAP42	Q04372	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ENT1	Q12518	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PET122	P10355	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ACA1	P39970	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SKP2	P42843	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	NMD5	P46970	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	TPO3	Q06451	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PTP1	P25044	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ERC1	P38767	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PUG1	P40100	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	YAT1	P80235	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	FRE7	Q12333	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	MSM1	P22438	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	CLB4	P24871	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	FTH1	P38310	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	NET1	P47035	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	GTB1	Q04924	702 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	RAD34	Q06665	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SUL2	Q12325	893 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	NPA3	P47122	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	SLM3	Q12093	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	MAK32	P23060	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	URK1	P27515	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	PTH2	P34222	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	MRPL36	P36531	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	YBR138C	P38277	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	UBX6	P47049	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	TAM41	P53230	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	YGR079W	P53249	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	MDG1	P53885	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	VPS72	Q03388	795 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ELF1	YKL160W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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