RNA–Protein interactions for RNA: YKL008C

LAC1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAC1, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAC1	YKL008C	NMD5	P46970	1048 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	MSY1	P48527	492 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	ATG23	Q06671	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TMA16	Q08687	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SLC1	P33333	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YPT53	P36019	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	GEX2	P36173	615 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YPR003C	P53394	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	RSC9	Q03124	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	VID22	Q05934	901 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SPO16	P17122	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	BAG7	Q12128	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	YSP3	P25036	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	DPB3	P27344	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	CNS1	P33313	385 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	AXL2	P38928	823 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SNO3	P43544	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	IRC7	P43623	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	ASE1	P50275	885 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	REG1	Q00816	1014 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	THI3	Q07471	609 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	SSP2	Q08646	371 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LAC1	YKL008C	PCT1	P13259	424 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PSD1	P39006	500 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SWA2	Q06677	668 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PEP1	P32319	1579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YLR302C	O13544	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	BPT1	P14772	1559 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PTP1	P25044	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	RIC1	P40395	1056 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SNO4	Q04902	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	HSP32	Q08992	237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PFA4	Q12006	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ERG8	P24521	451 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	MSS51	P32335	436 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	RRN3	P36070	627 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YER010C	P40011	234 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ORC5	P50874	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	CRN1	Q06440	651 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	HSL1	P34244	1518 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	COQ3	P27680	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SSH4	P32343	579 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	UBP13	P38187	747 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	LTP1	P40347	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	CDC1	P40986	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	FCP1	Q03254	732 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	VCX1	Q99385	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	ASG1	P40467	964 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	NET1	P47035	1189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	CRC1	Q12289	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	GAL4	P04386	881 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YCR006C	P25350	157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	RER1	P25560	188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SRB5	P32585	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	TFC3	P34111	1160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PHM8	P40025	321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YIL024C	P40543	189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	SWP82	P43554	623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	CBK1	P53894	756 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	STP1	Q00947	519 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	PDR8	Q06149	701 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAC1	YKL008C	TAF2	P23255	1407 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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