RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C TPM1P17536 199 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C HOP1P20050 605 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data2.54□□□□□ -2not detected
GCN4YEL009C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C YBL028CP38202 106 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C CDS1P38221 457 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C RTS1P38903 757 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C FTR1P40088 404 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C VID27P40157 782 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C YIL089WP40500 205 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C MDV1P47025 714 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C GUD1Q07729 489 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C NRT1Q08485 598 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C CSR2Q12734 1121 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C RAD61Q99359 647 aa2.54□□□□□ -2
GCN4YEL009C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data2.53□□□□□ -2 RIP-Chip
GCN4YEL009C PEP3P27801 918 aa2.53□□□□□ -2
GCN4YEL009C PRE4P30657 266 aa2.53□□□□□ -2
GCN4YEL009C IMP2'P32351 346 aa2.53□□□□□ -2
GCN4YEL009C YPT10P38146 199 aa2.53□□□□□ -2
GCN4YEL009C CST26P38226 397 aa2.53□□□□□ -2
GCN4YEL009C IRC7P43623 340 aa2.53□□□□□ -2
GCN4YEL009C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RNR2P09938 399 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PRE8P23639 250 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RIT1P23796 513 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YJU2P28320 278 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PRO3P32263 286 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ANP1P32629 500 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MYO3P36006 1272 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VPS8P39702 1274 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ACA1P39970 489 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YIL152WP40455 235 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SPO22P40511 975 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YIR014WP40570 242 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YIR016WP40572 265 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C WAR1Q03631 944 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C USA1Q03714 838 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C HRD3Q05787 833 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C UBX3Q12229 455 aa2.52□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SWI6P09959 803 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SAM2P19358 384 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.51□□□□□ -2.01not detected
GCN4YEL009C MAK31P23059 88 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CHS3P29465 1165 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CCL1P37366 393 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C EHT1P38295 451 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C OCA5P38738 679 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PES4P39684 611 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CSM2P40465 213 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VID28P40547 921 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C LYS14P40971 790 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C BFA1P47113 574 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C FOL1P53848 824 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C ARP5P53946 755 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YPL071CQ02864 156 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TFB2Q02939 513 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SKG3Q06315 1026 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TFC6Q06339 672 aa2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TUS1Q06412 1307 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C BI2P03873 423 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C NUC1P08466 329 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MATALPHA2P0CY08 210 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PCT1P13259 424 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C KRS1P15180 591 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C COQ3P27680 312 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C OCT1P35999 772 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TDA3P38758 523 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VPS45P38932 577 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C EPL1P43572 832 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CTF18P49956 741 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C TAF4P50105 388 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YML037CQ03703 340 aa2.5□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C YCR043CP25361 127 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C BMH2P34730 273 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C APE3P37302 537 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C OPY1P38271 328 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C VAB2P40003 282 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C MGS1P40151 587 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C PRM2P40534 656 aa2.49□□□□□ -2.01
GCN4YEL009C RET2P43621 546 aa2.49□□□□□ -2.01
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