RNA–Protein interactions for RNA: YDR419W

RAD30, Transcript of DNA polymerase eta, yeast

Gene RAD30, Length 1,899 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD30	YDR419W	STP1	Q00947	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	MUB1	Q03162	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SKY1	Q03656	742 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	CIR2	Q08822	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TAF10	Q12030	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	GNT1	Q12096	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	AEP2	P22136	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	FRE1	P32791	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	DOM34	P33309	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	RPC37	P36121	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	CCL1	P37366	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SWC5	P38326	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SAP185	P40856	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SPC98	P53540	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	APC5	Q08683	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	EMP46	Q12396	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	VPS5	Q92331	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	HAP2	P06774	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YSC84	P32793	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SRB2	P34162	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	MRPL7	P36519	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	MSG5	P38590	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YMR134W	P40207	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	KHA1	P40309	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RAD30	YDR419W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YJR120W	P47157	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	VPS54	Q12071	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TPK1	P06244	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	RAD1	P06777	1100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	POA1	P38218	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	POP4	P38336	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YHR202W	P38887	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	LYS9	P38999	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	CIN4	P39110	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	ARG2	P40360	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TMA108	P40462	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	INA22	P40576	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YNL320W	P42840	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	POL31	P46957	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	NMD5	P46970	1048 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TAF9	Q05027	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	STE23	Q06010	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	OMS1	Q06668	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	THI20	Q08224	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SLY1	P22213	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	PLC1	P32383	869 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SLA2	P33338	968 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SLX1	P38324	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	VHC1	P38329	1120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YIL054W	P40524	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	THI7	Q05998	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	GPM2	Q12008	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SEY1	Q99287	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	ADH4	P10127	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	MEI4	P29467	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	YME1	P32795	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	TKL2	P33315	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	CAB3	P36076	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	APN2	P38207	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	HSL7	P38274	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	ERP2	P39704	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SIT1	P39980	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	ASG7	P46993	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	GPG1	P53130	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	SNO2	P53823	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	PRM6	Q04705	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	RSC58	Q07979	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD30	YDR419W	THI21	Q08975	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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