RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PIF1	P07271	859 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	STF2	P16965	84 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ATP12	P22135	325 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RIT1	P23796	513 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CIN5	P40917	295 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
EXO1	YOR033C	TDA10	P42938	290 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	EMP47	P43555	445 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GLG2	P47011	380 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CTF18	P49956	741 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YGR125W	P53273	1036 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	DID2	P69771	204 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	VHS1	Q03785	461 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	URC2	Q04411	772 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YPR091C	Q06833	770 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YDL114W	Q07530	308 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YRR1	Q12172	810 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	OSW2	Q12202	724 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ATG34	Q12292	412 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	AHC1	Q12433	566 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YCR051W	P25631	222 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MLS1	P30952	554 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FUN30	P31380	1131 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FUN26	P31381	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CLG1	P35190	452 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	STB6	P36085	766 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CDS1	P38221	457 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SEN34	P39707	275 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PKP1	P40530	394 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SOL4	P53315	255 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YPL034W	Q03083	165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	DSE3	Q08729	430 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	DCS2	Q12123	353 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MMP1	Q12372	583 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	INH1	P01097	85 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GAL3	P13045	520 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YPK2	P18961	677 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ESS1	P22696	170 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	VAM7	P32912	316 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YFR018C	P43599	363 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.2	□□□□□ -1.58	not detected
EXO1	YOR033C	NMD5	P46970	1048 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	AIM24	P47127	394 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TAF4	P50105	388 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ROM1	P53046	1155 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NMA111	P53920	997 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NHP10	Q03435	203 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SNX41	Q04053	625 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	UFO1	Q04511	668 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CRR1	Q05790	422 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ISU2	Q12056	156 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FMP16	Q12497	93 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ATG11	Q12527	1178 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	LAG2	Q92325	660 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MDS3	P53094	1487 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SCEI	P03882	235 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	URA3	P03962	267 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PHO8	P11491	566 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TFC1	P32367	649 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SCT1	P32784	759 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NIC96	P34077	839 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TAF14	P35189	244 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NEM1	P38757	446 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GDH3	P39708	457 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PIG2	P40187	538 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ASG1	P40467	964 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	UFE1	P41834	346 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	COS4	P43542	379 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YJL007C	P47080	104 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	COS5	P47187	383 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YGR021W	P53212	290 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YNR068C	P53754	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms