RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	MOB1	P40484	314 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	BIO4	P53630	237 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	HST2	P53686	357 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TEP1	P53916	434 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YNL058C	P53947	316 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	RPN4	Q03465	531 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	NSE5	Q03718	556 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	CDC123	Q05791	360 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YCS4	Q06156	1176 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	KCS1	Q12494	1050 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.04	□□□□□ -0.64	not detected
DDR2	YOL052C-A	ATP12	P22135	325 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	MIH1	P23748	554 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	APM3	P38153	483 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TAF6	P53040	516 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YGL140C	P53120	1219 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	RCF2	P53721	224 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YNR063W	P53749	607 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	NHX1	Q04121	633 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	SLD7	Q08457	257 aa		11.04	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	PEP8	P40335	379 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YTP1	P53584	459 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YMR206W	Q03695	313 aa		11.03	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	MSH2	P25847	964 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MRP21	P38175	177 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	SEO1	P39709	593 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	EXO1	P39875	702 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	UBP7	P40453	1071 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	EFM6	P53970	246 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	SHE9	Q04172	456 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TAF11	Q04226	346 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	SEG1	Q04279	960 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YDR109C	Q04585	715 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	SPE4	Q12455	300 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	RGS2	Q99188	309 aa		11.02	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.01	□□□□□ -0.65	not detected
DDR2	YOL052C-A	AMD2	P22580	549 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MRE11	P32829	692 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	CYM1	P32898	989 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YBR062C	P38239	180 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YJL206C	P39529	758 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MRX1	P40050	688 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	PEX8	P53248	589 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TIM13	P53299	105 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TUB4	P53378	473 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	NUP100	Q02629	959 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TRS31	Q03337	283 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YLR177W	Q06251	628 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	ADY3	Q07732	790 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TRE2	Q08693	809 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	NDD1	Q08887	554 aa		11.01	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	CLN1	P20437	546 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MRPL8	P22353	238 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	AAD3	P25612	363 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	GDA1	P32621	518 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	COY1	P34237	679 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TFA2	P36145	328 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	HSM3	P38348	480 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YHI9	P38765	294 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MEF2	P39677	819 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	AMA1	P50082	593 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	PEX11	Q12462	236 aa		11	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.99	□□□□□ -0.65	not detected
DDR2	YOL052C-A	CLB1	P24868	471 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	YSP3	P25036	478 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	MNN1	P39106	762 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	HEM14	P40012	539 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	RGI2	P40188	164 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	ARH1	P48360	493 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	BUD32	P53323	261 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	IPI3	P53877	555 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDR2	YOL052C-A	TFB2	Q02939	513 aa		10.99	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.8 ms