RNA–Protein interactions for RNA: YMR178W

YMR178W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YMR178W, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR178W	YMR178W	BST1	P43571	1029 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	UBX6	P47049	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YML122C	Q03207	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	RIM13	Q03792	727 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	STP3	Q05937	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	BSP1	Q06604	576 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	IRC3	Q06683	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	COX1	P00401	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YGR021W	P53212	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YNL058C	P53947	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	SEG1	Q04279	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	TPO3	Q06451	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	COX17	Q12287	69 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	FRE7	Q12333	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	MDM10	P18409	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	LAC1	P28496	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	RAD16	P31244	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	NUP120	P35729	1037 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	NPR3	P38742	1146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YAT1	P80235	687 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	GTB1	Q04924	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	PSR2	Q07949	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	SSM4	P40318	1319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	TPK1	P06244	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	MTF2	P10849	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	MBR1	P23493	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	BEM3	P32873	1128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YPT53	P36019	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	IFA38	P38286	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	XBP1	P40489	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	GTR1	Q00582	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR178W	YMR178W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YMR178W	YMR178W	PTC6	P25646	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	XRS2	P33301	854 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	FTH1	P38310	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	COG1	P53079	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	RAD34	Q06665	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	PCD1	Q12524	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	PSY4	P38193	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	EXO84	P38261	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	UME6	P39001	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	BUD16	P39988	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	NMD5	P46970	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	IML2	P47031	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	SWT1	Q12104	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	PTP1	P25044	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	HES1	P35843	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	CIN1	P40987	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	SNO3	P43544	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	ATG23	Q06671	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	MAK32	P23060	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	GSH1	P32477	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	DJP1	P40564	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	IRC7	P43623	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	RSC9	Q03124	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	SPO16	P17122	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	MSY1	P48527	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	CTF18	P49956	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TMA16	Q08687	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YMR178W	YMR178W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms