RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	GLG2	P47011	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YTP1	P53584	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CAF40	P53829	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MPS1	P54199	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FLC1	Q08967	793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ARG82	P07250	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GAL3	P13045	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	OM45	P16547	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SAN1	P22470	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	AAD3	P25612	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CPR3	P25719	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PEX6	P33760	1030 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RER2	P35196	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ARA1	P38115	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	KTR4	P38131	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CEM1	P39525	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PES4	P39684	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GPB2	P39717	880 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MTW1	P39731	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FRT2	P39734	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MEP1	P40260	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATH1	P48016	1211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PEX21	P50091	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FMP45	Q07651	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RSC58	Q07979	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MCD1	Q12158	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YSP3	P25036	478 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CWH43	P25618	953 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ITR1	P30605	584 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PMT2	P31382	759 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	NUP2	P32499	720 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KTR2	P33550	425 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MDJ1	P35191	511 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	VHC1	P38329	1120 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YFR018C	P43599	363 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SSY1	Q03770	852 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	BNA7	Q04066	261 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	VTA1	Q06263	330 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	LDB17	Q12342	491 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SNF4	P12904	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KSS1	P14681	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SNT1	P25357	1226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	BLI1	P35727	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MET1	P36150	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YJL107C	P42947	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SAD1	P43589	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COS5	P47187	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MRK1	P50873	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SNF12	P53628	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GOR1	P53839	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TBF1	Q02457	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PET117	Q02771	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RSC9	Q03124	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SPO20	Q04359	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SPC2	Q04969	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	EAF1	Q06337	982 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COS7	Q07788	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	FEX1	Q08913	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	OXR1	Q08952	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GRX6	Q12438	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GCR1	P07261	785 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PUT2	P07275	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TOP3	P13099	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	STE12	P13574	688 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	APN1	P22936	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MSG5	P38590	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YHR078W	P38799	552 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YJR061W	P40355	935 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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