RNA–Protein interactions for RNA: YKL167C

MRP49, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRP49, Length 414 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP49	YKL167C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	QRI7	P43122	407 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	RTT103	Q05543	409 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	YOR389W	Q08912	624 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	PFA4	Q12006	378 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	PSF3	Q12146	194 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MRP49	YKL167C	PHO81	P17442	1178 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PHO3	P24031	467 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ERP2	P39704	215 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ACA1	P39970	489 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	EAF5	P39995	279 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ERR3	P42222	437 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	IRC5	P43610	853 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	NUR1	Q12066	484 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YOL114C	Q12322	202 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SEC12	P11655	471 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SDS22	P36047	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	STL1	P39932	569 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ASK10	P48361	1146 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	COG2	P53271	262 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YML131W	Q03102	365 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	CIA1	Q05583	330 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	HIM1	Q06674	414 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	TAF5	P38129	798 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	VRG4	P40107	337 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SAD1	P43589	448 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YPT11	P48559	417 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	COG4	Q06096	861 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ARP7	Q12406	477 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	VPS5	Q92331	675 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SDH8	P38345	138 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	RAD26	P40352	1085 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SAP185	P40856	1058 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SKP2	P42843	763 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	TEP1	P53916	434 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	RAD34	Q06665	692 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PSR2	Q07949	397 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	RRI1	Q12468	440 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	CNA1	P23287	553 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PPZ1	P26570	692 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SSH4	P32343	579 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	TGL1	P34163	548 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YBR139W	P38109	508 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	LAS21	P40367	830 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	MNT2	P53059	558 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YML119W	Q03208	357 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	TRS130	Q03660	1102 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ARA2	Q04212	335 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SSP2	Q08646	371 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	ADH4	P10127	382 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	CBP3	P21560	335 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	MSM1	P22438	575 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	AMD2	P22580	549 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	MSH1	P25846	959 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SWD1	P39706	426 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	SPC72	P39723	622 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	MAD3	P47074	515 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PEF1	P53238	335 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	GTR1	Q00582	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	UBP16	Q02863	499 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	PLM2	Q04383	521 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MRP49	YKL167C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	CWH43	P25618	953 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	MCM10	P32354	571 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	APM3	P38153	483 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	YLF2	P38746	405 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	ERV46	P39727	415 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	IMA5	P40884	581 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	MAD2	P40958	196 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	MDR1	P53258	950 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MRP49	YKL167C	YNL144C	P53907	740 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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