RNA–Protein interactions for RNA: YJR005C-A

LSO1, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene LSO1, Length 282 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LSO1	YJR005C-A	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ADK2	P26364	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	HEM3	P28789	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
LSO1	YJR005C-A	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SLA2	P33338	968 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
LSO1	YJR005C-A	BIT2	P38346	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	AIM18	P38884	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YHR202W	P38887	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	PRM9	P39551	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	STL1	P39932	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	CDC1	P40986	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	MAF1	P41910	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	TAF1	P46677	1066 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SAE2	P46946	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	POL31	P46957	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YJL132W	P47014	750 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	IML2	P47031	731 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RFX1	P48743	811 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SKP1	P52286	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	BIO4	P53630	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YNL011C	P53980	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	KTR6	P54070	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	UBX4	P54730	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	DOS2	P54858	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SLG1	P54867	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YML119W	Q03208	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SHE9	Q04172	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	HRD3	Q05787	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ADY3	Q07732	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	LDB17	Q12342	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	AVL9	Q12500	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	AI3	P03877	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ERR1	P0CX10	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ERR2	P0CX11	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	MAS1	P10507	462 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SNT1	P25357	1226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YIH1	P25637	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	TOA1	P32773	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SCD5	P34758	872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ETR1	P38071	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YBR056W	P38081	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ERR3	P42222	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	TDA10	P42938	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	TAH11	P47112	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	TAF6	P53040	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	NUT1	P53114	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ADI1	Q03677	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YML083C	Q04526	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YET3	Q07451	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	NRT1	Q08485	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YCL068C	P25593	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	CDC20	P26309	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	MET4	P32389	672 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	COY1	P34237	679 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	HMT1	P38074	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YBR053C	P38235	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RIM4	P38741	713 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	LAM1	P38851	1228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ECM1	P39715	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YEL028W	P39989	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	FIR1	P40020	876 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ATM1	P40416	690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	FAR3	P46671	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YPR003C	P53394	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	GTR1	Q00582	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	VPS16	Q03308	798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	YDR338C	Q05497	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SVS1	Q12254	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	GPM3	Q12326	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	SPE4	Q12455	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LSO1	YJR005C-A	APM4	Q99186	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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