RNA–Protein interactions for RNA: YHR197W

RIX1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeastyeast

Gene RIX1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIX1YHR197W ATF1P40353 525 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.07□□□□□ -1.92not detected
RIX1YHR197W INP52P50942 1183 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W CUL3P53202 744 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YGR045CP53229 120 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ABZ2Q03266 374 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W CRR1Q05790 422 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ADY4Q05955 493 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W XYL2Q07993 356 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W SKM1Q12469 655 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W VCX1Q99385 411 aa3.07□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-FP0CX61 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-CP25383 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YCR051WP25631 222 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W LOT5P34234 306 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W DAD2P36162 133 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W DED81P38707 554 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W UME6P39001 836 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MET12P46151 657 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W COG1P53079 417 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MUB1Q03162 620 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-DR2Q03483 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ASM4Q05166 528 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W SPH1Q06160 661 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RSB1Q08417 382 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY3A-GQ12173 290 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-BQ12260 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-OR2Q12293 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-DR1Q12392 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-OR1Q12439 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY3A-IQ99219 290 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YOR019WQ99248 730 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TY2A-DR3Q99303 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W FBP1P09201 348 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W NFS1P25374 497 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MSP1P28737 362 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W BUD2P33314 1104 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MRPL40P36534 297 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TAF5P38129 798 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MMS4P38257 691 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W REI1P38344 393 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MTG2P38860 518 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W SET5P38890 526 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W VPS45P38932 577 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W INA22P40576 216 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W BUD8P41698 603 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W EFM3P47163 339 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W AAD10P47182 288 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W KEL2P50090 882 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TEL2P53038 688 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TAM41P53230 385 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RIA1P53893 1110 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YNL050CP53952 270 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W REX2P54964 269 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YLR456WQ06199 204 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W CRD1Q07560 283 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W UAF30Q08747 228 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YOR022CQ12204 715 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ATG11Q12527 1178 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YOR111WQ99210 232 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YRF1-4O13559 1382 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W TRP3P00937 484 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ERS1P17261 260 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ERG8P24521 451 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W SPS22P25380 463 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W PHO91P27514 894 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RPD3P32561 433 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W GCV2P49095 1034 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YBP2P53169 641 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ADA2Q02336 434 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W PEX19Q07418 342 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W RCN2Q12044 265 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ELG1Q12050 791 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W VPS54Q12071 889 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W HUA2Q12134 243 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W YLR122CQ12312 125 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W ADF1Q2V2Q1 113 aa3.05□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W JIP3O13555 125 aa3.04□□□□□ -1.92
RIX1YHR197W CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
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