RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C OPT1P40897 799 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GSM1P42950 618 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YFH7P43591 353 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C INM2Q05533 292 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YPS7Q06325 596 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SNA4Q07549 140 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RAD50P12753 1312 aa2.6□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PHO8P11491 566 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C IME1P21190 360 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.59□□□□□ -1.99not detected
GCN4YEL009C YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C RPT3P33298 428 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C MTG2P38860 518 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C FLO5P38894 1075 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YIL024CP40543 189 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C TDA10P42938 290 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C TIM50Q02776 476 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C FDC1Q03034 503 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YLR407WQ06070 228 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C YLR125WQ12138 136 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C PSF3Q12146 194 aa2.59□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C FLO11P08640 1367 aa2.59□□□□□ -2
GCN4YEL009C HKR1P41809 1802 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C CYB2P00175 591 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C VAS1P07806 1104 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C YMR085WP0CF18 432 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C SNF3P10870 884 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C THI4P32318 326 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C YOX1P34161 385 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C STV1P37296 890 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C GRX7P38068 203 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C OSH3P38713 996 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C BUD8P41698 603 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C YFL015CP43578 164 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C VPS4P52917 437 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C MET13P53128 600 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C PIB2P53191 635 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C BUD17P53727 317 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C BOP3P53958 396 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C MFM1Q02783 413 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C UGO1Q03327 502 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C CRF1Q04930 467 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C YPL216WQ08964 1102 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C YLR278CQ05854 1341 aa2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
GCN4YEL009C HPR1P17629 752 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C AAP1P37898 856 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C PPE1P38796 400 aa2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C NOP2P40991 618 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C SKP2P42843 763 aa2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C YGR117CP53270 476 aa2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C YMR210WQ03649 449 aa2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C RIM20Q12033 661 aa2.57□□□□□ -2
GCN4YEL009C CBP1P07252 654 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C YEL076C-AP0CX16 216 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C YLR464WP0CX17 216 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C OPI1P21957 404 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C LOT5P34234 306 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C BRN1P38170 754 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C YEL076CP39971 216 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C SAE2P46946 345 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C HLR1Q04429 423 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C NTG2Q08214 380 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C TAH18Q12181 623 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C AIM44Q99299 758 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C FLO1P32768 1537 aa2.56□□□□□ -2
GCN4YEL009C COQ1P18900 473 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C MAL31P38156 614 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data2.55□□□□□ -2not detected
GCN4YEL009C RRP8P38961 392 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C PEA2P40091 420 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C PXA1P41909 870 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C SAP4P53036 818 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C PPN1Q04119 674 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C SMA2Q04658 369 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C RTT103Q05543 409 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C TPO3Q06451 622 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C STP4Q07351 490 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C YLR001CQ07895 862 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C PCL8Q08966 492 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C TGS1Q12052 315 aa2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
GCN4YEL009C CHO2P05374 869 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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