RNA–Protein interactions for RNA: YDR368W

YPR1, Transcript of NADPH-dependent aldo-keto reductase, yeast

Gene YPR1, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR1	YDR368W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	RTT107	P38850	1070 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	YGL260W	P53056	76 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	CTT1	P06115	562 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	MSS51	P32335	436 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	ERC1	P38767	581 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	SIP1	P32578	815 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	NIC96	P34077	839 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	POL31	P46957	487 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	SCW10	Q04951	389 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	THI3	Q07471	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YPR1	YDR368W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YBR071W	P38243	211 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	UBP12	P39538	1254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	KAR1	P11927	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	SWC3	P31376	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	SAD1	P43589	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YGL081W	P53156	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	BET4	Q00618	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PDR8	Q06149	701 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	SLX4	Q12098	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PDE1	P22434	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	TGL1	P34163	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	TAF5	P38129	798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	VRG4	P40107	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PHO3	P24031	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	OCT1	P35999	772 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PCL6	P40038	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	CDC1	P40986	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	VPS25	P47142	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YPR003C	P53394	754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YNL034W	P53963	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	VPS64	Q03944	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PPZ1	P26570	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	RKM3	P38222	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YLF2	P38746	405 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	VPS41	P38959	992 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	NPA3	P47122	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	CRD1	Q07560	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	LAC1	P28496	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YND1	P40009	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	QRI7	P43122	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	AIM6	Q07716	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	SDS22	P36047	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	MNN2	P38069	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YEN1	P40028	759 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PHM6	Q05637	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	PIG1	Q06216	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	MCH4	Q08268	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	NUR1	Q12066	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	TMA17	Q12513	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR1	YDR368W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	COG6	P53959	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	RTT103	Q05543	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	AAD4	Q07747	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	COX1	P00401	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	ADH4	P10127	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	UBP8	P50102	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	IZH1	Q03419	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	CAC2	Q04199	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	FMP42	Q04991	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	HES1	P35843	434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	SAW1	P39735	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	IMA5	P40884	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	YJR120W	P47157	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	SKP2	P42843	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	SWF1	Q04629	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	POS5	Q06892	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	TFC4	P33339	1025 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	SWD1	P39706	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	UBX6	P47049	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	ARP9	Q05123	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	ECI1	Q05871	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	BZZ1	P38822	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	ASG1	P40467	964 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR1	YDR368W	YGR079W	P53249	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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