RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xirp2Q4U4S6 3784 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10542F6XDR3 90 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SelenowP63300 88 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl35aO55142 110 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xcl1P47993 114 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700011M02RikB1AX35 88 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11020F6ZGD5 61 aa14.61□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1810062G17RikG3X8Y2 129 aa14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tm2d2Q8R0I4 213 aa14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufa3Q9CQ91 84 aa14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4861Q8C5A4 106 aa14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim20D3Z7Q2 69 aa14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RetnQ99P87 114 aa14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ss18l2Q9D174 77 aa14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spata3Q9D9T6 193 aa14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav3-4A0A075B654 114 aa14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GfyJ3KML8 504 aa14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01745 121 aa14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmo1Q5SXG7 201 aa14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PkigO70139 76 aa14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01729 129 aa14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r32Q148A4 427 aa14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfand2aQ9JII7 171 aa14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Esm1Q9QYY7 184 aa14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf740Q6NZQ6 180 aa14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MobpQ9D2P8 170 aa14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spry2Q9QXV8 315 aa14.51□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pglyrp4Q0VB07 374 aa14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apoc4Q61268 124 aa14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa14.5□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defb50Q6TU36 73 aa14.49□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psors1c2Q80ZC9 134 aa14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prss58Q8BW11 241 aa14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10772F7AIG4 85 aa14.48□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nop10Q9CQS2 64 aa14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tenm1Q9WTS4 2731 aa14.47□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcl1b3P56842 122 aa14.46□□□□□ -0.09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ntn5Q3UQ22 452 aa14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smim26Q3V460 107 aa14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mzt1Q8BUR9 78 aa14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpha2Q925Q5 128 aa14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygfQ9CXV3 174 aa14.45□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv1-117A0A140T8M0 119 aa14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap16-1A2A5X5 502 aa14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spink1P09036 80 aa14.42□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9513B3GLJ6 99 aa14.41□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sprr1bQ62267 153 aa14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10647E9Q8X0 124 aa14.4□□□□□ -0.1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygdP04342 174 aa14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrygeQ03740 174 aa14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930544G11RikQ9CR99 193 aa14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnal4Q9DCM4 105 aa14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav13-4-dv7A0A075B6C2 110 aa14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spink4O35679 86 aa14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa1P11477 93 aa14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trav9d-3A0A075B695 113 aa14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp951A0A087WRH0 451 aa14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igf1P05017 153 aa14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa25Q5G864 92 aa14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cmc4Q61908 68 aa14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8R092 253 aa14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hivep3A2A884 2348 aa14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa14.33□□□□□ -0.11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 P01755 137 aa14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Defa16P50714 93 aa14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pfn2Q9JJV2 140 aa14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klk11Q9QYN3 276 aa14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Notch3Q61982 2318 aa14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv1-99F6XWB2 120 aa14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Csdc2Q91YQ3 154 aa14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Brwd1Q921C3 2304 aa14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hbb-b2P02089 147 aa14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Odf3l2Q3TZ65 277 aa14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TnxbO35452 4006 aa14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.7 ms