Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y2

1810062G17Rik, MCG1049552, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810062G17RikG3X8Y2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
1810062G17RikG3X8Y2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
1810062G17RikG3X8Y2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
1810062G17RikG3X8Y2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
1810062G17RikG3X8Y2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1810062G17RikG3X8Y2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
1810062G17RikG3X8Y2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1810062G17RikG3X8Y2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
1810062G17RikG3X8Y2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1810062G17RikG3X8Y2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
1810062G17RikG3X8Y2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
1810062G17RikG3X8Y2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1810062G17RikG3X8Y2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1810062G17RikG3X8Y2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1810062G17RikG3X8Y2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
1810062G17RikG3X8Y2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
1810062G17RikG3X8Y2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1810062G17RikG3X8Y2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1810062G17RikG3X8Y2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
1810062G17RikG3X8Y2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1810062G17RikG3X8Y2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1810062G17RikG3X8Y2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1810062G17RikG3X8Y2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1810062G17RikG3X8Y2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1810062G17RikG3X8Y2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1810062G17RikG3X8Y2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
1810062G17RikG3X8Y2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1810062G17RikG3X8Y2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
1810062G17RikG3X8Y2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810062G17RikG3X8Y2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1810062G17RikG3X8Y2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810062G17RikG3X8Y2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810062G17RikG3X8Y2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1810062G17RikG3X8Y2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1810062G17RikG3X8Y2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810062G17RikG3X8Y2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810062G17RikG3X8Y2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810062G17RikG3X8Y2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810062G17RikG3X8Y2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810062G17RikG3X8Y2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810062G17RikG3X8Y2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810062G17RikG3X8Y2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810062G17RikG3X8Y2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
1810062G17RikG3X8Y2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810062G17RikG3X8Y2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1810062G17RikG3X8Y2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1810062G17RikG3X8Y2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1810062G17RikG3X8Y2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1810062G17RikG3X8Y2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810062G17RikG3X8Y2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810062G17RikG3X8Y2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
1810062G17RikG3X8Y2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810062G17RikG3X8Y2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810062G17RikG3X8Y2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1810062G17RikG3X8Y2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810062G17RikG3X8Y2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810062G17RikG3X8Y2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810062G17RikG3X8Y2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810062G17RikG3X8Y2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
1810062G17RikG3X8Y2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1810062G17RikG3X8Y2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1810062G17RikG3X8Y2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1810062G17RikG3X8Y2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1810062G17RikG3X8Y2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1810062G17RikG3X8Y2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
1810062G17RikG3X8Y2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1810062G17RikG3X8Y2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1810062G17RikG3X8Y2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
1810062G17RikG3X8Y2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1810062G17RikG3X8Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1810062G17RikG3X8Y2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1810062G17RikG3X8Y2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
1810062G17RikG3X8Y2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1810062G17RikG3X8Y2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1810062G17RikG3X8Y2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810062G17RikG3X8Y2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810062G17RikG3X8Y2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810062G17RikG3X8Y2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1810062G17RikG3X8Y2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810062G17RikG3X8Y2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810062G17RikG3X8Y2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810062G17RikG3X8Y2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1810062G17RikG3X8Y2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810062G17RikG3X8Y2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810062G17RikG3X8Y2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1810062G17RikG3X8Y2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1810062G17RikG3X8Y2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1810062G17RikG3X8Y2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1810062G17RikG3X8Y2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810062G17RikG3X8Y2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1810062G17RikG3X8Y2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1810062G17RikG3X8Y2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810062G17RikG3X8Y2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1810062G17RikG3X8Y2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms