RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm7735D3YX18 52 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa35E9QLQ1 93 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ly6lH3BJG9 140 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esp3J3QN49 87 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5294J3QP53 216 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01741 114 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sox15P43267 231 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crip1P63254 77 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr904Q7TRC9 310 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr433Q7TRV9 314 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa22Q8C1N8 93 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il19Q8CJ70 176 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chac1Q8R3J5 223 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp6v0bQ91V37 205 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl16Q99N93 251 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hyls1Q9CXX0 307 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cby1Q9D1C2 127 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Card19Q9D1I2 183 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ociad2Q9D8W7 154 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnase4Q9JJH1 148 aa3.84□□□□□ -1.79
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-69A0A0G2JFS5 117 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Shisal2aA2A9G7 189 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem262D3Z338 116 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r1E9PVR6 306 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tcte2E9PY37 120 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BC030500E9Q6W0 185 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ebi3O35228 228 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igll1P20764 209 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccl6P27784 116 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gng4P50153 75 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 V1rd19Q3KNP5 305 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tal2Q62282 108 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 QrfpQ8CE23 124 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnase2aQ8K196 155 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RpeQ8VEE0 228 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1243Q8VGM7 305 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Map1lc3aQ91VR7 121 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lypd5Q9D7Z7 256 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Morn5Q9DAI9 170 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube2l6Q9QZU9 153 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm15294V9GXA7 121 aa3.83□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smim13E9Q942 88 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm28305F6U473 122 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1185-ps1F6XP16 303 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PrlhG3UWC3 86 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm5426J3QNM7 103 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Emp2O88662 172 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Saa3P04918 122 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cox7cP17665 63 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AW146154Q3TPQ7 468 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pmis2Q497Q9 96 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cox11Q6P8I6 275 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10118Q8C8J5 116 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr981Q8VEU2 310 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fxyd4Q9D2W0 88 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RhohQ9D3G9 191 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tspan13Q9D8C2 204 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EppinQ9DA01 134 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm26938S4R185 226 aa3.82□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnah11E9Q7N9 4488 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-53A0A075B5W3 117 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6525A0A0A6YW33 106 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cox8cA6H666 72 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hbb-bsA8DUK4 147 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esp38A8R0X1 80 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr235E9Q9Z6 312 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa30E9QPZ2 93 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bak1O08734 209 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01756 117 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01757 117 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hbb-b1P02088 147 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prm1P02319 51 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P06334 169 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NpsP0C0P8 89 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chtf8P0CG14 533 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf239P24399 201 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cacng7P62956 275 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ndufa4l2Q4FZG9 87 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd33Q63994 403 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clec4b2Q67DU8 208 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 2010109I03RikQ9CQ11 111 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PpdpfQ9CR37 115 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wfdc2Q9DAU7 174 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 OtorQ9JIE3 128 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa3.81□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps13bQ80TY5 3993 aa3.8□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trbv31A0A075B5J5 111 aa3.8□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa3.8□□□□□ -1.8
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trav14-2A0A075B694 121 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.6 ms