Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE0

Rpe, Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpeQ8VEE0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RpeQ8VEE0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RpeQ8VEE0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RpeQ8VEE0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RpeQ8VEE0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RpeQ8VEE0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RpeQ8VEE0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RpeQ8VEE0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RpeQ8VEE0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RpeQ8VEE0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RpeQ8VEE0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RpeQ8VEE0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RpeQ8VEE0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RpeQ8VEE0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RpeQ8VEE0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RpeQ8VEE0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RpeQ8VEE0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RpeQ8VEE0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RpeQ8VEE0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RpeQ8VEE0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RpeQ8VEE0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RpeQ8VEE0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RpeQ8VEE0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RpeQ8VEE0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RpeQ8VEE0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpeQ8VEE0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpeQ8VEE0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
RpeQ8VEE0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RpeQ8VEE0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpeQ8VEE0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpeQ8VEE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpeQ8VEE0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RpeQ8VEE0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RpeQ8VEE0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RpeQ8VEE0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RpeQ8VEE0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RpeQ8VEE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RpeQ8VEE0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RpeQ8VEE0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RpeQ8VEE0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpeQ8VEE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpeQ8VEE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpeQ8VEE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RpeQ8VEE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpeQ8VEE0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RpeQ8VEE0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpeQ8VEE0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpeQ8VEE0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RpeQ8VEE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpeQ8VEE0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpeQ8VEE0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RpeQ8VEE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpeQ8VEE0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpeQ8VEE0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpeQ8VEE0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpeQ8VEE0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpeQ8VEE0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpeQ8VEE0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpeQ8VEE0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpeQ8VEE0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RpeQ8VEE0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpeQ8VEE0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpeQ8VEE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RpeQ8VEE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RpeQ8VEE0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RpeQ8VEE0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpeQ8VEE0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpeQ8VEE0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpeQ8VEE0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpeQ8VEE0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpeQ8VEE0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpeQ8VEE0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpeQ8VEE0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpeQ8VEE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RpeQ8VEE0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpeQ8VEE0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpeQ8VEE0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpeQ8VEE0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpeQ8VEE0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RpeQ8VEE0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RpeQ8VEE0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RpeQ8VEE0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RpeQ8VEE0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpeQ8VEE0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RpeQ8VEE0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RpeQ8VEE0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RpeQ8VEE0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RpeQ8VEE0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RpeQ8VEE0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RpeQ8VEE0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RpeQ8VEE0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RpeQ8VEE0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RpeQ8VEE0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RpeQ8VEE0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms