Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z7

Lypd5, Ly6/PLAUR domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd5Q9D7Z7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lypd5Q9D7Z7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lypd5Q9D7Z7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lypd5Q9D7Z7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lypd5Q9D7Z7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lypd5Q9D7Z7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lypd5Q9D7Z7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lypd5Q9D7Z7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lypd5Q9D7Z7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lypd5Q9D7Z7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lypd5Q9D7Z7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lypd5Q9D7Z7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lypd5Q9D7Z7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lypd5Q9D7Z7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lypd5Q9D7Z7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lypd5Q9D7Z7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lypd5Q9D7Z7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lypd5Q9D7Z7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lypd5Q9D7Z7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lypd5Q9D7Z7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lypd5Q9D7Z7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lypd5Q9D7Z7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lypd5Q9D7Z7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lypd5Q9D7Z7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lypd5Q9D7Z7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lypd5Q9D7Z7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lypd5Q9D7Z7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lypd5Q9D7Z7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lypd5Q9D7Z7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lypd5Q9D7Z7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lypd5Q9D7Z7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lypd5Q9D7Z7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lypd5Q9D7Z7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lypd5Q9D7Z7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lypd5Q9D7Z7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lypd5Q9D7Z7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lypd5Q9D7Z7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lypd5Q9D7Z7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lypd5Q9D7Z7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lypd5Q9D7Z7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lypd5Q9D7Z7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lypd5Q9D7Z7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lypd5Q9D7Z7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lypd5Q9D7Z7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lypd5Q9D7Z7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lypd5Q9D7Z7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lypd5Q9D7Z7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lypd5Q9D7Z7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lypd5Q9D7Z7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lypd5Q9D7Z7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lypd5Q9D7Z7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lypd5Q9D7Z7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lypd5Q9D7Z7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lypd5Q9D7Z7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lypd5Q9D7Z7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lypd5Q9D7Z7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lypd5Q9D7Z7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lypd5Q9D7Z7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lypd5Q9D7Z7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lypd5Q9D7Z7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lypd5Q9D7Z7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lypd5Q9D7Z7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lypd5Q9D7Z7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lypd5Q9D7Z7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lypd5Q9D7Z7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lypd5Q9D7Z7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lypd5Q9D7Z7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lypd5Q9D7Z7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lypd5Q9D7Z7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lypd5Q9D7Z7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lypd5Q9D7Z7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lypd5Q9D7Z7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lypd5Q9D7Z7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lypd5Q9D7Z7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lypd5Q9D7Z7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lypd5Q9D7Z7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lypd5Q9D7Z7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lypd5Q9D7Z7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lypd5Q9D7Z7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lypd5Q9D7Z7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lypd5Q9D7Z7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lypd5Q9D7Z7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lypd5Q9D7Z7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lypd5Q9D7Z7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lypd5Q9D7Z7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lypd5Q9D7Z7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lypd5Q9D7Z7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lypd5Q9D7Z7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lypd5Q9D7Z7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lypd5Q9D7Z7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lypd5Q9D7Z7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lypd5Q9D7Z7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lypd5Q9D7Z7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lypd5Q9D7Z7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lypd5Q9D7Z7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lypd5Q9D7Z7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lypd5Q9D7Z7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lypd5Q9D7Z7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lypd5Q9D7Z7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lypd5Q9D7Z7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms