Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
V1rd19Q3KNP5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
V1rd19Q3KNP5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
V1rd19Q3KNP5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
V1rd19Q3KNP5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
V1rd19Q3KNP5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
V1rd19Q3KNP5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
V1rd19Q3KNP5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
V1rd19Q3KNP5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
V1rd19Q3KNP5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
V1rd19Q3KNP5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
V1rd19Q3KNP5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
V1rd19Q3KNP5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
V1rd19Q3KNP5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
V1rd19Q3KNP5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
V1rd19Q3KNP5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V1rd19Q3KNP5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
V1rd19Q3KNP5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
V1rd19Q3KNP5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
V1rd19Q3KNP5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
V1rd19Q3KNP5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
V1rd19Q3KNP5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V1rd19Q3KNP5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
V1rd19Q3KNP5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
V1rd19Q3KNP5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
V1rd19Q3KNP5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
V1rd19Q3KNP5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
V1rd19Q3KNP5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
V1rd19Q3KNP5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
V1rd19Q3KNP5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V1rd19Q3KNP5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
V1rd19Q3KNP5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
V1rd19Q3KNP5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V1rd19Q3KNP5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
V1rd19Q3KNP5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V1rd19Q3KNP5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
V1rd19Q3KNP5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
V1rd19Q3KNP5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
V1rd19Q3KNP5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V1rd19Q3KNP5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
V1rd19Q3KNP5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V1rd19Q3KNP5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
V1rd19Q3KNP5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
V1rd19Q3KNP5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
V1rd19Q3KNP5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
V1rd19Q3KNP5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
V1rd19Q3KNP5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
V1rd19Q3KNP5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
V1rd19Q3KNP5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
V1rd19Q3KNP5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V1rd19Q3KNP5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V1rd19Q3KNP5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V1rd19Q3KNP5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V1rd19Q3KNP5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
V1rd19Q3KNP5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V1rd19Q3KNP5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V1rd19Q3KNP5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
V1rd19Q3KNP5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V1rd19Q3KNP5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V1rd19Q3KNP5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
V1rd19Q3KNP5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
V1rd19Q3KNP5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
V1rd19Q3KNP5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
V1rd19Q3KNP5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
V1rd19Q3KNP5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
V1rd19Q3KNP5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
V1rd19Q3KNP5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
V1rd19Q3KNP5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
V1rd19Q3KNP5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
V1rd19Q3KNP5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
V1rd19Q3KNP5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
V1rd19Q3KNP5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
V1rd19Q3KNP5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
V1rd19Q3KNP5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
V1rd19Q3KNP5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V1rd19Q3KNP5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
V1rd19Q3KNP5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
V1rd19Q3KNP5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
V1rd19Q3KNP5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
V1rd19Q3KNP5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
V1rd19Q3KNP5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
V1rd19Q3KNP5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
V1rd19Q3KNP5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
V1rd19Q3KNP5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
V1rd19Q3KNP5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms