RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	PTP1	P25044	335 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	YKL133C	P36066	463 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	SWD1	P39706	426 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	XBP1	P40489	647 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	TGL2	P54857	326 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	TRS31	Q03337	283 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	ENT2	Q05785	613 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.48	□□□□□ -1.69	not detected
YKR070W	YKR070W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	YLF2	P38746	405 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	LAS21	P40367	830 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	COG2	P53271	262 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	VPS64	Q03944	604 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	CRD1	Q07560	283 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	PCL8	Q08966	492 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	ARP7	Q12406	477 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YKR070W	YKR070W	MAM1	P40065	302 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	UBP16	Q02863	499 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	AFT2	Q08957	416 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	NYV1	Q12255	253 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	NUP159	P40477	1460 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	GDA1	P32621	518 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	IMA5	P40884	581 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	POL31	P46957	487 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YNL058C	P53947	316 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	CRF1	Q04930	467 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	AAD4	Q07747	329 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	NUP170	P38181	1502 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	TDA10	P42938	290 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	TEP1	P53916	434 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YML119W	Q03208	357 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YCR061W	P25639	631 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	BEM3	P32873	1128 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	LTP1	P40347	161 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	NET1	P47035	1189 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	MAD3	P47074	515 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	MET14	Q02196	202 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	RAD33	Q04231	177 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YML053C	Q04978	212 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	GSY2	P27472	705 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	SWC3	P31376	625 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	SIP1	P32578	815 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	HIS6	P40545	261 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YNL092W	P53934	400 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	TPO3	Q06451	622 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	MLC2	Q06580	163 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	BSP1	Q06604	576 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	HIM1	Q06674	414 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	CYK3	Q07533	885 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	SIN3	P22579	1536 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	GAL1	P04385	528 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	AMD2	P22580	549 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	MBR1	P23493	339 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	CIR1	P42940	261 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	SNO3	P43544	222 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	ARA2	Q04212	335 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	PLM2	Q04383	521 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	HRD3	Q05787	833 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YKR070W	YKR070W	MSH1	P25846	959 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	PTP2	P29461	750 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	APM3	P38153	483 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	CAB2	P40506	365 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	SAE2	P46946	345 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	NMD5	P46970	1048 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	GLO1	P50107	326 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	FRE7	Q12333	620 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	ATP4	P05626	244 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	POL3	P15436	1097 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YKR070W	YKR070W	RAD26	P40352	1085 aa		4.39	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.6 ms