RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W TAH18Q12181 623 aa5.12□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W THR1P17423 357 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YCR061WP25639 631 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MRP20P32387 263 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data5.11□□□□□ -1.59not detected
YKR047WYKR047W SIP4P46954 829 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MFM1Q02783 413 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W STP3Q05937 343 aa5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W PGS1P25578 521 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W HRR25P29295 494 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ESL2P36168 1195 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W SGM1P47166 707 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YGR151CP53287 111 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W DIP5P53388 608 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MRPL19P53875 158 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W RNT1Q02555 471 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YKU80Q04437 629 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W RCO1Q04779 684 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W AIM39Q08223 395 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TMA16Q08687 178 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W HUA2Q12134 243 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YOR111WQ99210 232 aa5.1□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W TUB2P02557 457 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ALG7P07286 448 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W SGF29P25554 259 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W LNP1P38878 278 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W PSD1P39006 500 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ARC1P46672 376 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ASE1P50275 885 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W PHO23P50947 330 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W VPS4P52917 437 aa5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W DUO1P53168 247 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
YKR047WYKR047W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SPO16P17122 198 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ERG8P24521 451 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W URK1P27515 501 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SAC6P32599 642 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W NOP4P37838 685 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W APL3P38065 1025 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YBR225WP38321 900 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SDH8P38345 138 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W FMP10P40098 244 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W IRC6P43615 237 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W NMA2P53204 395 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YSA1Q01976 231 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W UFO1Q04511 668 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W MFB1Q04922 465 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YLR287CQ05881 355 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ENT4Q07872 247 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YPL216WQ08964 1102 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W NUS1Q12063 375 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RKI1Q12189 258 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W FUR1P18562 216 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W OLE1P21147 510 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W PRE8P23639 250 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W PPS1P38148 807 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W TDP1P38319 544 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SUL1P38359 859 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W THI6P41835 540 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YIP4P53093 235 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SNF12P53628 566 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W DAK1P54838 584 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W FCP1Q03254 732 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YLR040CQ07988 224 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SCM3Q12334 223 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YER175W-AQ8TGU4 54 aa5.07□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SEC53P07283 254 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W HCM1P25364 564 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RNQ1P25367 405 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W THI80P35202 319 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ALY1P36117 915 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W CCL1P37366 393 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W KTR3P38130 404 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W PFK26P40433 827 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ARE2P53629 642 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W BUD17P53727 317 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ATG4P53867 494 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RIA1P53893 1110 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W USA1Q03714 838 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RAD30Q04049 632 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W VCX1Q99385 411 aa5.06□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W GCN4P03069 281 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SUI3P09064 285 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W PDE1P22434 369 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.6 ms