RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	NMD4	Q12129	218 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	RTN2	Q12443	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
VMA22	YHR060W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	ORC2	P32833	620 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	YPT7	P32939	208 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	SPO22	P40511	975 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	ZAP1	P47043	880 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	VPS62	P53285	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	ZDS2	P54786	942 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	FDC1	Q03034	503 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	IRC3	Q06683	689 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	HIS5	P07172	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	DAL5	P15365	543 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	REC107	P21651	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	CDC20	P26309	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	MDL1	P33310	695 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	RXT2	P38255	430 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YHR112C	P38716	378 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	AAD10	P47182	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	NRG1	Q03125	231 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YML119W	Q03208	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	AIM6	Q07716	390 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	HMI1	Q12039	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	CDC6	P09119	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	CBS1	P14066	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YCK1	P23291	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	CLB3	P24870	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	CDC15	P27636	974 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	STE14	P32584	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	SSU1	P41930	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	IDS2	P46958	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	MRX6	P48564	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	TRM11	Q12463	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PCD1	Q12524	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	STE11	P23561	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PEX1	P24004	1043 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	EMC1	P25574	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	AAD3	P25612	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	DCG1	P32460	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	UBP11	P36026	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	REG2	P38232	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	RTS1	P38903	757 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	POP2	P39008	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YJL193W	P39542	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	FTR1	P40088	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YNL195C	P40168	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YJL055W	P47044	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	GPI8	P49018	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	DSD1	P53095	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	YGR066C	P53242	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	REG1	Q00816	1014 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	RAD30	Q04049	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PEX19	Q07418	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PSR1	Q07800	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	ENT4	Q07872	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	TCO89	Q08921	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	PGC1	Q08959	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	ICL2	Q12031	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	RIM20	Q12033	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	SUL2	Q12325	893 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	STF1	P01098	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	VPS33	P20795	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	VPS34	P22543	875 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	MNE1	P24720	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	STE50	P25344	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VMA22	YHR060W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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