RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TARDBP-231	ENST00000639599		H7BZZ5	65 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-231	ENST00000639599	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-231	ENST00000639599	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-231	ENST00000639599	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TARDBP-231	ENST00000639599	UQCR11	O14957	56 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TARDBP-231	ENST00000639599		K7ERS5	55 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TARDBP-231	ENST00000639599	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM258	P61165	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TARDBP-231	ENST00000639599	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TARDBP-231	ENST00000639599		V9GYY9	64 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TARDBP-231	ENST00000639599	PSPHP1	O15172	72 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TARDBP-231	ENST00000639599	MT1A	P04731	61 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TARDBP-231	ENST00000639599	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TARDBP-231	ENST00000639599		A6NED7	52 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TARDBP-231	ENST00000639599		Q1T7F1	81 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TARDBP-231	ENST00000639599	ROMO1	P60602	79 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TARDBP-231	ENST00000639599	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TARDBP-231	ENST00000639599	PCP4	P48539	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TARDBP-231	ENST00000639599	MT3	P25713	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TARDBP-231	ENST00000639599	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0A0MQY5	61 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TARDBP-231	ENST00000639599	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TARDBP-231	ENST00000639599	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TARDBP-231	ENST00000639599	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TARDBP-231	ENST00000639599	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TARDBP-231	ENST00000639599	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TARDBP-231	ENST00000639599	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TARDBP-231	ENST00000639599	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TARDBP-231	ENST00000639599	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.52	□□□□□ -2.01
TARDBP-231	ENST00000639599	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.28	□□□□□ -2.04
TARDBP-231	ENST00000639599	INE1	O15225	51 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TARDBP-231	ENST00000639599	PRM1	P04553	51 aa		2.15	□□□□□ -2.07
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.83	□□□□□ -2.12

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