RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577887.1

SNORD53B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53B, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa0.56□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa0.56□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa0.56□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE1DQ5T752 114 aa0.56□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 A6NED7 52 aa0.55□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 A8MU10 97 aa0.55□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE3AQ5TA76 89 aa0.55□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.55□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 MT1MQ8N339 61 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 MT1LQ93083 61 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa0.53□□□□□ -2.32
SNORD53B-201ENST00000577887 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP23-1A1A580 65 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 PSPHP1O15172 72 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa0.52□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC179H3BU77 68 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 ROMO1P60602 79 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 Q1T7F1 81 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 BRK1Q8WUW1 75 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa0.5□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE3CQ5T5A8 94 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa0.48□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 LOC100996750A0A140TA64 210 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 MT1AP04731 61 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 MT3P25713 68 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD53B-201ENST00000577887 OBSCNQ5VST9 7968 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa0.46□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-8O75690 187 aa0.44□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 LUZP6Q538Z0 58 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-2Q701N4 177 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 PCP4P48539 62 aa0.42□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 PMAIP1Q13794 54 aa0.42□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE1BQ5T7P3 118 aa0.42□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 MUC5ACP98088 5654 aa0.41□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE1EQ5T753 118 aa0.41□□□□□ -2.34
SNORD53B-201ENST00000577887 SVIPQ8NHG7 77 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa0.39□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa0.39□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE1CQ5T751 118 aa0.38□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE3DQ9BYE3 92 aa0.38□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE1FQ5T754 118 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 LCE3EQ5T5B0 92 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 PRO0628Q9UI54 55 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD53B-201ENST00000577887 PHGR1C9JFL3 82 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 PRAC1Q96KF2 57 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD53B-201ENST00000577887 A0A0A0MQY5 61 aa0.27□□□□□ -2.37
SNORD53B-201ENST00000577887 NDUFAF8A1L188 74 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD53B-201ENST00000577887 PRM1P04553 51 aa0.24□□□□□ -2.37
SNORD53B-201ENST00000577887 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD53B-201ENST00000577887 INE1O15225 51 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD53B-201ENST00000577887 H3BS24 57 aa0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms