RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-7.12□□□□□ -3.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFF3Q07654 80 aa-7.13□□□□□ -3.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 XIRP2A4UGR9 3374 aa-7.15□□□□□ -3.55
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC400499M0QZD8 3231 aa-7.18□□□□□ -3.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNG2P59768 71 aa-7.2□□□□□ -3.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMIM2Q9BVW6 85 aa-7.23□□□□□ -3.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGLP35573 1532 aa-7.26□□□□□ -3.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-7.27□□□□□ -3.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-7.33□□□□□ -3.58
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB133Q30KQ1 61 aa-7.36□□□□□ -3.59
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLNP26678 52 aa-7.37□□□□□ -3.59
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASPMQ8IZT6 3477 aa-7.45□□□□□ -3.6
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-7.45□□□□□ -3.6
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLTCL1P53675 1640 aa-7.46□□□□□ -3.6
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPS1P31327 1500 aa-7.47□□□□□ -3.6
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRPM2O94759 1503 aa-7.52□□□□□ -3.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-7.52□□□□□ -3.61
RNU6-277P-201ENST00000516272 CENPFP49454 3210 aa-7.54□□□□□ -3.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDCD5O14737 125 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-7.56□□□□□ -3.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD52P31358 61 aa-7.6□□□□□ -3.63
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRCA2P51587 3418 aa-7.61□□□□□ -3.63
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTN1P15515 57 aa-7.63□□□□□ -3.63
RNU6-277P-201ENST00000516272 VCANP13611 3396 aa-7.65□□□□□ -3.63
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDH23Q9H251 3354 aa-7.65□□□□□ -3.63
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-7.66□□□□□ -3.64
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOMM7Q9P0U1 55 aa-7.67□□□□□ -3.64
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-7.69□□□□□ -3.64
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFCAB5A4FU69 1503 aa-7.73□□□□□ -3.65
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A096LNI7 61 aa-7.74□□□□□ -3.65
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQGAP1P46940 1657 aa-7.77□□□□□ -3.65
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRXQ9BXM0 1461 aa-7.78□□□□□ -3.65
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFAT5O94916 1531 aa-7.78□□□□□ -3.66
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFA1O15239 70 aa-7.85□□□□□ -3.67
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS13AQ96RL7 3174 aa-7.91□□□□□ -3.68
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WWC5 75 aa-7.94□□□□□ -3.68
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADCY10Q96PN6 1610 aa-7.96□□□□□ -3.68
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMIM5Q71RC9 77 aa-8.08□□□□□ -3.7
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB124Q8NES8 71 aa-8.12□□□□□ -3.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCC8Q09428 1581 aa-8.13□□□□□ -3.71
RNU6-277P-201ENST00000516272 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-8.16□□□□□ -3.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 CMC2Q9NRP2 79 aa-8.17□□□□□ -3.72
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-8.29□□□□□ -3.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-8.39□□□□□ -3.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-8.54□□□□□ -3.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-8.56□□□□□ -3.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-8.56□□□□□ -3.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01556Q5JQF7 62 aa-8.58□□□□□ -3.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 UTRNP46939 3433 aa-8.7□□□□□ -3.8
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-8.82□□□□□ -3.82
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP7AQ04656 1500 aa-8.85□□□□□ -3.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-8.89□□□□□ -3.83
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BUX3 64 aa-8.96□□□□□ -3.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MROH2BQ7Z745 1585 aa-8.99□□□□□ -3.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-9.42□□□□□ -3.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-9.45□□□□□ -3.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 APELAP0DMC3 54 aa-9.46□□□□□ -3.92
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A096LPF7 62 aa-9.58□□□□□ -3.94
RNU6-277P-201ENST00000516272 IQGAP2Q13576 1575 aa-9.62□□□□□ -3.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 K7EIM0 57 aa-9.64□□□□□ -3.95
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-9.71□□□□□ -3.96
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOMM5Q8N4H5 51 aa-9.83□□□□□ -3.98
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRCDQ00LT1 54 aa-9.92□□□□□ -4
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-9.93□□□□□ -4
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTN3P15516 51 aa-9.96□□□□□ -4
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-10.06□□□□□ -4.02
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q9Y3F1 56 aa-10.57□□□□□ -4.1
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-10.74□□□□□ -4.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BSH0 61 aa-10.82□□□□□ -4.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-10.83□□□□□ -4.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL39P5Q59GN2 51 aa-10.86□□□□□ -4.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB108AA8MXU0 73 aa-10.99□□□□□ -4.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 COX14Q96I36 57 aa-11.2□□□□□ -4.2
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEFB108BQ8NET1 73 aa-11.72□□□□□ -4.29
RNU6-277P-201ENST00000516272 STATHP02808 62 aa-12.73□□□□□ -4.45
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 5.8 ms