RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 TFF3Q07654 80 aa-3.48□□□□□ -2.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-3.49□□□□□ -2.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM2Q9BVW6 85 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLTCL1P53675 1640 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP34Q70CQ2 3546 aa-3.52□□□□□ -2.97
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-3.54□□□□□ -2.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLNP26678 52 aa-3.55□□□□□ -2.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 CPS1P31327 1500 aa-3.57□□□□□ -2.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-3.59□□□□□ -2.98
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRPM2O94759 1503 aa-3.61□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFB133Q30KQ1 61 aa-3.62□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-3.63□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDCD5O14737 125 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-3.64□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 XIRP2A4UGR9 3374 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 UNC80Q8N2C7 3258 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 EFCAB5A4FU69 1503 aa-3.65□□□□□ -2.99
RNU6-601P-201ENST00000384540 IQGAP1P46940 1657 aa-3.67□□□□□ -3
RNU6-601P-201ENST00000384540 LOC400499M0QZD8 3231 aa-3.69□□□□□ -3
RNU6-601P-201ENST00000384540 HTN1P15515 57 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD52P31358 61 aa-3.74□□□□□ -3.01
RNU6-601P-201ENST00000384540 NFAT5O94916 1531 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-601P-201ENST00000384540 TOMM7Q9P0U1 55 aa-3.75□□□□□ -3.01
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRXQ9BXM0 1461 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADCY10Q96PN6 1610 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFA1O15239 70 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A096LNI7 61 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASPMQ8IZT6 3477 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A087WWC5 75 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABCC8Q09428 1581 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM5Q71RC9 77 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPFP49454 3210 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-601P-201ENST00000384540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-601P-201ENST00000384540 BRCA2P51587 3418 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-601P-201ENST00000384540 VCANP13611 3396 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-601P-201ENST00000384540 CMC2Q9NRP2 79 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-3.97□□□□□ -3.05
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDH23Q9H251 3354 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFB124Q8NES8 71 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-601P-201ENST00000384540 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS13AQ96RL7 3174 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-601P-201ENST00000384540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-601P-201ENST00000384540 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP7AQ04656 1500 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01556Q5JQF7 62 aa-4.25□□□□□ -3.09
RNU6-601P-201ENST00000384540 MROH2BQ7Z745 1585 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BUX3 64 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-601P-201ENST00000384540 UTRNP46939 3433 aa-4.49□□□□□ -3.13
RNU6-601P-201ENST00000384540 IQGAP2Q13576 1575 aa-4.57□□□□□ -3.14
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-4.58□□□□□ -3.14
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-4.6□□□□□ -3.15
RNU6-601P-201ENST00000384540 APELAP0DMC3 54 aa-4.7□□□□□ -3.16
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A096LPF7 62 aa-4.76□□□□□ -3.17
RNU6-601P-201ENST00000384540 K7EIM0 57 aa-4.8□□□□□ -3.18
RNU6-601P-201ENST00000384540 TOMM5Q8N4H5 51 aa-4.8□□□□□ -3.18
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRCDQ00LT1 54 aa-4.89□□□□□ -3.19
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-4.91□□□□□ -3.2
RNU6-601P-201ENST00000384540 HTN3P15516 51 aa-4.95□□□□□ -3.2
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-4.97□□□□□ -3.21
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-5.05□□□□□ -3.22
RNU6-601P-201ENST00000384540 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-5.19□□□□□ -3.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q9Y3F1 56 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-5.33□□□□□ -3.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BSH0 61 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL39P5Q59GN2 51 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFB108AA8MXU0 73 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 COX14Q96I36 57 aa-5.59□□□□□ -3.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFB108BQ8NET1 73 aa-5.86□□□□□ -3.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 STATHP02808 62 aa-6.4□□□□□ -3.43
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 6 ms